1991年，市纠正部门和行业不正之风办公室设在市监察局，自成立之日起，始终坚持以维护群众利益为根本目的，将工作重点放在社会和群众关注的热点和焦点问题上。初期工作主要以端正行业作风、减轻农民和企业负担为重点。在端正行业作风方面，1991—1992年，根据全省统一部署，开展清理整顿着装工作，全市共清理擅自着装的部门16个、着装22种。对全市184个乡镇的3457个基层站所进行以端正行业作风为重点的全面整顿，对每一个基层站所进行评议，清理出各种罚款、收费416项，纠正不合理项目158项。1993—1994年，根据上级要求和本地实际情况，市监察局起草《关于进一步抓好纠风工作的意见》，提出“四刹一整顿”的纠风任务，对党政机关团体侵占企业资金、使用公车婚嫁、各种代币购物券、违规购买汽车等不正之风开展专项检查。2000年，纠正部门和行业不正之风工作从市纪委党风室转移到市行政机关办事效率投诉中心。纠风工作的范围进一步扩大，以维护群众利益为出发点和落脚点，围绕医疗、卫生、教育等重点领域开展各种专项整治工作。
公路“三乱”治理
1992年起，针对公路“三乱”问题进行集中整顿，组织开展专项检查，取缔各类非法站卡，收缴处罚票据和违规罚款，查处各种“三乱”行为和违法案件，经过几年严格整治，1999年顺利通过山东省对济宁市国道、省道、县乡道和航道基本无“三乱”的达标验收。2001年，针对路查暗访中发现的问题，专门召开各县（市、区）和市直职能部门负责人会议，通报11起公路“三乱”问题。2002年，继续加大监督检查力度，全年共组织检查43次，查处公路“三乱”案件26起，给予6人党政纪处分。2003年，顺利通过山东省治理公路“三乱”工作检查组的验收。2004年，查处公路“三乱”问题14件，给予党政纪处分4人，取消对机动车辆的行政事业性收费、摊派等项目25项。2005年，全市共取消对机动车辆行政事业性收费、基金、集资、摊派项目4项，涉及金额653万元；取消道路收费站点1个，聘请治理公路“三乱”监督员237人，创建省级文明执法示范路1条，查处公路“三乱”问题8起，处理5人。2006—2010年，始终将治理公路“三乱”作为工作重点，实行重点路段日常监控，不定期组织专项整治和明察暗访活动，严厉查处公路“三乱”行为和违纪问题，确保济宁市公路（航道）基本无“三乱”。
济宁市注重反腐倡廉宣传教育的“精细化”，在开展普遍性教育的基础上，对一些特殊群体开展针对性教育，做到因人施教、对症下药。图为2008年3月20日在济宁运河宾馆举办的全市领导干部家属和身边工作人员廉政报告会会场。
维护群众利益
1993—1999年，坚持开展“两减一清理”工作。1999年，按照中央和山东省统一要求，推行“两证一卡”制度、收费年审制度和物价巡视员制度。2000—2001年，加大查处涉农案件和减轻农民负担的工作力度，共查处涉农案件31起，给予党政纪处分69人。2002年，全面开展全市农村税费改革工作，组织人员深入农村基层对农民负担工作明查暗访，共查处影响经济发展环境、违反农村政策加重农民负担等方面的案件11起。2003年，进一步完善涉及农民负担案（事）件的责任追究制度，在6月和11月，采取随机抽样的方法，开展两次专项检查。2004年，会同市减负办对向农民乱收费、乱集资、加重农民负担问题进行调查和专项清查。纠正城镇拆迁中侵害居民利益问题，清理拖欠农民工工资和征用农民集体土地补偿费。对企业重组、破产、改制中侵害职工合法权益的问题进行调查处理。2005年，针对土地征用中侵害群众利益、城镇拆迁中侵害居民利益、企业重组改制破产中侵害职工合法权益、拖欠克扣农民工工资和企业违法排污危害群众健康五个方面的突出问题，加大专项治理力度。对农民粮食直补款发放情况进行专项检查。2006年，实行涉农收费价格“公示制”、农村订阅报刊“限额制”和涉农负担案（事）件“责任追究制”。2007年，纠正房屋拆迁违规违法行为11起。撤销评比达标表彰项目39个。开展争创“三无”乡镇和“察民情、解民忧、促和谐、保稳定”下访月活动。2008—2010年，严厉查处拖欠农民工工资案件和涉农乱收费、乱摊派行为。督促有关部门深化新型农村合作医疗改革。2010年，市纪委监察局、市农委印发《关于坚决制止加重农民负担行为的紧急通知》，开展专项督导检查。
行风建设
2000年，组织进行“万家企业评行风”活动，并从人大代表、政协委员和企业单位中聘请10名同志为济宁市优化环境、纠正行业不正之风特邀监督员。2001年，市纠风办与市文明办共同印发《关于公布全市创建文明行业示范点的通知》，组织54个示范点单位参与评选。积极发挥特邀监督员的作用，两次召开优化发展环境、纠正不正之风特邀监督员座谈会。2002年，认真组织开展行风民主评议活动，制定《济宁市教育系统行风民主评议实施意见》，组织召开全市教育系统行风民主评议动员大会。2003年，召开全市“民主评行风、优化经济环境”活动工作会议，499个部门和单位参加行风评议活动。在总结汇总的基础上，向省推荐6个省级基层行风建设示范窗口单位，确定表彰48个市级基层行风建设示范窗口单位。2004年，组织全市119个部门和单位参加“万名代表评机关”和《民主评议行风》活动，发放评议票1万张，回收率98.65%。此后每年定期组织开展“双评”活动，并将评议结果进行公布。2000年1月10日，市纠风办与市广播电台联合开办“政风行风热线”栏目，并一直延续；2010年5月12日，整合媒体资源，该栏目实现升级扩版，上线部门由48个增加到61个，直播时间延长到50分钟，市级领导和各县（市、区）党政领导上线。行风有效改善，取得良好社会效果。
纠正医疗卫生不正之风
重点抓好纠正医药购销中不正之风工作，在全市范围内清理、取缔无证照或证照不全的药品生产、批发企业，清理取缔非法诊所，严厉查处医药购销中的违纪违法案件，降低药品的虚高定价。2001年，在全市46家县级以上医院中，有34家实行药品集中招标采购、42家实行住院费用“一日清单”制度、29家实行病人选医生。2002年，召开全市县级以上医院民主评议总结表彰会议，组织进行三次系统的监督检查。2003年，在县级以上57家医疗单位实行药品集中招标采购，完善住院费用“一日清单”制度。2004年，组成4个调查组对全市20家县级以上非盈利性医院和部分专科医院集中开展大调查活动。2005年，召开纠正医药购销和医疗服务中不正之风工作会议，表彰一批全市卫生系统“廉洁行医树新风”先进单位和个人，组织开展“全市卫生行风建设先模事迹巡回报告”活动，出台《济宁市医疗机构药品集中招标不良行为处理办法》。2006年，总结推广济宁医学院附属医院“单病种限价”做法。2007年，在县级以上卫生医疗机构推行单病种限价收费制度，推出惠民诊疗、平价病房，实行辅助检查项目相互认可制度。2008年，县级以上医疗机构全部参加市级招标采购，市直医疗单位集中采购药品总金额2.16亿元。为城区困难职工发放“惠民医疗服务卡”。2010年，加大责任事故调查力度，处理病死婴儿遗弃事件责任人员18人。经过多年努力，医疗领域不正之风得到有效整治，有效缓解看病难、看病贵的情况，维护了患者利益。
治理教育乱收费
2001—2003年，市纪委联合市教育局印发《关于治理中小学乱收费的意见》《关于进一步治理中小学乱收费的意见》《关于加大治理教育乱收费工作力度的紧急通知》等一系列文件，治理教育乱收费工作成为纠风工作的重点。市纪委纠风室会同教育、财政、审计等部门组成联合调查组，对全市12个县（市、区）60多所学校的收费情况进行监督检查，清理取消各类不合理收费项目，制止强行征订教辅材料，降低教材价格，严厉查处中小学乱收费案件，并对典型案件进行通报，有效减轻学生家长经济负担。2004年，全市有153个乡镇、2096所中小学实行订阅报刊费用限额。2005—2007年，全面落实义务教育“一费制”和公办高中“三限”政策，实行“两免一补”，继续深入治理教育乱收费，加强对中小学经费管理使用情况的监督。2008年，全部免除城乡义务教育阶段学生杂费和农村义务教育阶段学生课本费。2009年，深化义务教育经费保障机制改革，免除农村义务教育阶段住宿费、课本费，为1万多名贫困寄宿生补助生活费。
清理庆典论坛研讨会
2010年，市纪委监察局、市财政局、市纠风办联合下发《关于对党政机关举办庆典、研讨会、论坛活动开展清理摸底的实施意见》，组织专项清理摸底活动，制止7起不符合要求的庆典活动。
2006年6月16日，济宁市第一人民医院治理商业贿赂专项工作动员大会召开。
