1991—1999年，是济宁进出口商品检验业务快速发展的重要时期。1999年，济宁进出口商品检验局自检商品34类120余种，经常有业务往来的生产经营单位360余家。济宁市获出口生产厂（库）卫生注册或质量许可证注册的企业121家，国外注册认证企业6家。山东如意毛纺厂、山东工具厂等13家生产企业获得ISO9000证书。1991—1999年，全市累计检验进出口商品35.23万批，货值17.11亿美元。检验出不合格商品455批，货值1138万美元；其中进口索赔199批，索赔金额492万美元。从1993年开始，开展外商投资财产鉴定工作，至1999年，共完成鉴定185批，申请鉴定金额7461.3万美元，鉴定价值6317.5万美元。1994年起，开展进口流通领域商品的监督管理工作，至1999年，累计检验监管进口家电等商品288批，1.32万台，货值6138万元，查出不合格商品2299台，办理退换货361台，挽回经济损失108万元。1993年底，抽派3名商检人员专门负责山东邹县发电厂三期工程2台60万千瓦火力发电工程进口设备的检验工作，到1998年结束驻厂检验工作，历时近5年，确保了邹县电厂三期工程2台60万千瓦机组顺利投产发电。1996年后，逐步将检验把关重点，向安全、卫生、健康、环境保护、防止欺诈等方面转移，其中机电产品涉及人身安全部分，是检验监管的重要内容之一。
2006—2010年，济宁市为出口企业“量身定做”检验监管模式。图为2009年指导木地板生产企业出口。
2000—2005年，济宁进出口商品检验业务规模不断扩大，2005年，在济宁注册或报检的出口企业有421家。出口产品主要有矿产品、机电产品、轻纺产品、农副产品等，进口产品主要有橡胶、机电产品、金属制品、棉花等。济宁检验检疫局探索科学、有效、方便、快捷的进出口商品检验检疫监管模式，推行出口分类管理、“过程检验”等模式，定期对生产过程进行监控，将出口检验延伸到生产过程中，与生产过程检验结合起来，减少检验成本，提高工作效率。2000年，调整出口煤炭品质检验模式，济宁作为产地检验检疫机构只负责实施产地监管和出口质量许可证管理，停止产地检验，取消两次收费。同年，对新组建的济宁如意印染有限公司进行ISO9000质量管理知识培训辅导，帮助企业建立健全与国际标准接轨的质量保证体系。2002年12月31日起，为保护环境，维护国家利益，依据国家质检总局《进口旧机电检验监督管理办法》加强对进口旧机电管理。2003年，济宁银河集团开始进口橡胶。同年，对出口服装、玩具等机电、轻纺产品企业进行分类管理，并实施了过程监管及抽查检验监管模式，对出口轻纺商品生产企业实施绿色通道管理。同年，出口印染布作为济宁检验检疫局电子审单快速核放首批试点的商品，济宁如意印染有限公司、济宁如意花布有限公司均顺利实施电子审单工作，济宁如意印染公司产品质量稳步提高，出口产品合格率96%以上。2004年，由于国际铝锭价格上涨，铝锭贸易大幅增加，济宁出口铝锭数量大幅度增加，济宁检验检疫局把检验向生产过程延伸，搞好批次管理，加大对铝锭的检验监管力度。同年，济宁如意印染公司通过中国质量认证中心（CQC）的ISO9001认证注册。兖矿集团200万吨焦化项目二手大型成套设备、太阳纸业技改项目、东方胶带轮胎项目等过千万美元的大项目监管取得明显成效。同年，兖州易路轮胎有限公司开始生产出口轮胎，公司于2005年6月与意大利的PERILI公司合资合作成立中外合资经营公司，子午线轮胎出口量大增。2005年，对出口服装采用电子监管系统，实现出口服装检验监管工作模式转变和重点转移，提高检验监管工作有效性。对诚信度较高的机电产品企业实行快速核放，济宁辖区健身器材、木工机械、汽车及其挂车、电子产品增长迅速，2005年与2004年同比出口批次、货值分别增长173.7%、85.99%。2005年12月，按照分类管理模式对出口煤炭生产加工企业实行质量诚信评价和分级动态管理制度，对质量诚信度较差或涉及安全、卫生、环保等风险程度较高的煤炭出口企业，实施驻矿（站）检验监管模式，济宁辖区7个出口煤矿顺利通过质量诚信评价和分级动态管理考核，获得最高级别A级管理资格。2001年至2006年5月1日前，济宁辖区进口棉花都是在口岸报检，受青岛检验检疫局委托，济宁局进行鉴重、扦取样品送山东检验检疫局技术中心检验。 2010年，济宁市开展“质量提升年”活动。图为济宁出入境检验检疫局工作人员对无叶风扇出口进行现场检验。
济宁出入境检验检疫局工作人员对进口轮胎实施现场检验（2009年摄）
2006—2010年，为出口工业品企业“量身定做”检验监管模式。根据工业品企业出口产品特点，以识别风险因素，分析客户要求为前提，以分类与动态管理相结合，以产品技术把关为保障，分别采取过程检验、型式试验、合格保证、符合性验证、抽批检验等分要素组合检验监管模式。经国家检验检疫局批准，山东如意科技集团成为一类管理企业，实现了济宁市一类企业零的突破。2010年，开展质量提升年活动，全年检出进口货物不合格588批，货值5621万美元，同比分别增长5.57%和74.84%。
2000—2005年，济宁进出口商品检验业务规模不断扩大，2005年，在济宁注册或报检的出口企业有421家。出口产品主要有矿产品、机电产品、轻纺产品、农副产品等，进口产品主要有橡胶、机电产品、金属制品、棉花等。济宁检验检疫局探索科学、有效、方便、快捷的进出口商品检验检疫监管模式，推行出口分类管理、“过程检验”等模式，定期对生产过程进行监控，将出口检验延伸到生产过程中，与生产过程检验结合起来，减少检验成本，提高工作效率。2000年，调整出口煤炭品质检验模式，济宁作为产地检验检疫机构只负责实施产地监管和出口质量许可证管理，停止产地检验，取消两次收费。同年，对新组建的济宁如意印染有限公司进行ISO9000质量管理知识培训辅导，帮助企业建立健全与国际标准接轨的质量保证体系。2002年12月31日起，为保护环境，维护国家利益，依据国家质检总局《进口旧机电检验监督管理办法》加强对进口旧机电管理。2003年，济宁银河集团开始进口橡胶。同年，对出口服装、玩具等机电、轻纺产品企业进行分类管理，并实施了过程监管及抽查检验监管模式，对出口轻纺商品生产企业实施绿色通道管理。同年，出口印染布作为济宁检验检疫局电子审单快速核放首批试点的商品，济宁如意印染有限公司、济宁如意花布有限公司均顺利实施电子审单工作，济宁如意印染公司产品质量稳步提高，出口产品合格率96%以上。2004年，由于国际铝锭价格上涨，铝锭贸易大幅增加，济宁出口铝锭数量大幅度增加，济宁检验检疫局把检验向生产过程延伸，搞好批次管理，加大对铝锭的检验监管力度。同年，济宁如意印染公司通过中国质量认证中心（CQC）的ISO9001认证注册。兖矿集团200万吨焦化项目二手大型成套设备、太阳纸业技改项目、东方胶带轮胎项目等过千万美元的大项目监管取得明显成效。同年，兖州易路轮胎有限公司开始生产出口轮胎，公司于2005年6月与意大利的PERILI公司合资合作成立中外合资经营公司，子午线轮胎出口量大增。2005年，对出口服装采用电子监管系统，实现出口服装检验监管工作模式转变和重点转移，提高检验监管工作有效性。对诚信度较高的机电产品企业实行快速核放，济宁辖区健身器材、木工机械、汽车及其挂车、电子产品增长迅速，2005年与2004年同比出口批次、货值分别增长173.7%、85.99%。2005年12月，按照分类管理模式对出口煤炭生产加工企业实行质量诚信评价和分级动态管理制度，对质量诚信度较差或涉及安全、卫生、环保等风险程度较高的煤炭出口企业，实施驻矿（站）检验监管模式，济宁辖区7个出口煤矿顺利通过质量诚信评价和分级动态管理考核，获得最高级别A级管理资格。2001年至2006年5月1日前，济宁辖区进口棉花都是在口岸报检，受青岛检验检疫局委托，济宁局进行鉴重、扦取样品送山东检验检疫局技术中心检验。 2010年，济宁市开展“质量提升年”活动。图为济宁出入境检验检疫局工作人员对无叶风扇出口进行现场检验。
济宁出入境检验检疫局工作人员对进口轮胎实施现场检验（2009年摄）
2006—2010年，为出口工业品企业“量身定做”检验监管模式。根据工业品企业出口产品特点，以识别风险因素，分析客户要求为前提，以分类与动态管理相结合，以产品技术把关为保障，分别采取过程检验、型式试验、合格保证、符合性验证、抽批检验等分要素组合检验监管模式。经国家检验检疫局批准，山东如意科技集团成为一类管理企业，实现了济宁市一类企业零的突破。2010年，开展质量提升年活动，全年检出进口货物不合格588批，货值5621万美元，同比分别增长5.57%和74.84%。