再贷款
1992—1993年，是济宁市再贷款运作的高峰期，年末余额分别为13.56亿元和15.44亿元。1993年，累计发放再贷款67.54亿元，是自1991年起发放额度最大的一年。1994年，济宁市再贷款年末余额0.18亿元。1995—1997年，再贷款余额分别为430万元、400万元、400万元。2004年末，济宁市短期再贷款限额上收分行。
支农再贷款 1999年，济宁市开始发放支农再贷款。全年对农村信用社累计发放支农再贷款1.99亿元。2000年，加大支农再贷款的投放，年末为3.1亿元。累计发放支农再贷款4.32亿元。2001年，再次增加农村信用社再贷款限额，年末限额为4.9亿元。全年累计发放再贷款7.45亿元。2002年，济宁市支农再贷款限额为6.5亿元。全年累计发放9.55亿元，较上年同期增加3.19亿元。2003年，累计发放7.42亿元，累计收回6.44亿元。2004年，全年共发放支农再贷款10.42亿元，年末限额和余额均达到8.15亿元。清收再贷款1.2亿元。2005年，支农再贷款余额1.75亿元，比同期减少6.4亿元。2006年，为全市农村信用社办理支农再贷款1.75亿元。2007—2010年，济宁市未发生支农再贷款业务。
地方政府专项借款 2000—2001年，济宁市发放政府专项借款4.5亿元。截至2010年12月末，累计归还政府专项借款2.77亿元，利息0.54亿元，政府专项借款余额1.73亿元。
再贴现
1994年11月，济宁市对国有商业银行持有的特定行业和企业贴现的银行承兑汇票，办理再贴现业务。至年末，办理再贴现业务42笔，4962万元。1997年，全年办理再贴现2.7亿元，年末余额5975万元。1999年，全年办理再贴现5.74亿元，年末再贴现余额2.59亿元。2000年，累计办理再贴现回购业务2172笔，8.75亿元。2002年末金额为零。2003年10月，再贴现业务重新启动，当年累计办理再贴现业务439笔，金额5.16亿元，年末再贴现余额4.98亿元。2010年3月9日，中国人民银行济宁市中心支行成功办理山东省首批次的电子商业汇票再贴现（买断式）业务，实现电子票据的全流程业务操作。