1994年后，济宁市国家税务局坚持“依法征税、应收尽收、坚决不收‘过头税’、坚决防止和制止越权减免税”的组织收入原则，加强税收分析，强化税源监控。国税收入在所有制结构、产业结构、行业结构等方面均得到优化。装备制造、能源化工、生物医药、纺织服装和食品等五大特色产业税收占税收总收入的比例不断加强，收入质量不断提高，欠税得到有效控制和清理。2010年，宏观税负水平达到7.61%，税收收入与GDP的弹性系数保持正相关水平，达到1.91，经济发展的成果在国税收入方面得到充分体现。
1994年，全市国税收入完成10.93亿元，1998年25.98亿元，1999年31.86亿元。增收主要集中于煤炭、电力、酒、纺织、机械、建材等几大支柱行业，合计增收4.96亿元，占增收总额的99.02%。2000年，全市国税收入完成33.58亿元，比上年增长5.41%。重点行业入库税收普遍下降，煤炭、电力、酿酒、商业四大支柱行业入库税收首次比上年下降，减收8524万元，其他税目增势微弱。
2004年，全市国税收入完成59.71亿元，比上年增长33.26%，比2000年（33.58亿元）翻了近一番，增收额超过税改初年1994年（10.93亿元），占GDP的比重达到5.56%。国税系统重点加强对煤炭企业的税收征管，采取推行电子监控系统、加强数据分析应用、应用煤炭行业评估分析系统等措施，探索出深化煤炭企业精细化管理的路子。煤炭行业增值税收入占全市增值税收入的比重超过50%，增收额占全部国税收入增收额的80%。
2008年，尽管受到国际金融危机的巨大影响，但全市国税收入总额、增幅、增收额依然处于历史较高水平，完成143.84亿元，增长23.44%，连续3年增幅保持在20%以上，增收27.3亿元，创历史最高增收额纪录。煤炭行业税收占全市国内税收收入的49.15%，拉动国内税收增长19.83个百分点，国税收入对煤炭行业的依赖有进一步加大的趋势。造纸行业受国际金融危机的冲击比较明显，增值税和企业所得税两税合计完成3.89亿元，同比下降28.57%，减收1.56亿元。
2009年，全市国税收入完成155.36亿元，比上年增长8.01%，税收总量突破150亿元。国税系统通过强化税收预警分析和纳税评估系统管理，增加税收4.3亿元。对银行、保险、电力、通信、石化五个行业及年纳税400万元以上的重点税源企业进行纳税检查，增加税收2.07亿元。开展涉外企业反避税调查，增加企业所得税1035万元。合计增加国税收入6.54亿元，拉动增幅4.55个百分点。
2010年，全市国税收入完成194.02亿元，比上年增长24.88%，增收38.66亿元。增值税、消费税、企业所得税、车辆购置税本年度全部同比增收。其中国内增值税139.92亿元，比上年增长15.72%，增收19.01亿元；消费税3.02亿元，比上年增长53.85%，增收1.06亿元；企业所得税23.78亿元，比上年增长40.51%，增收6.86亿元；车辆购置税8.51亿元，比上年增长44.06%，增收2.60亿元。个人利息所得税因政策原因，全年完成1958万元，比上年下降72.02%，减收5040万元。
图16-7-1 1994—2010年国税收入完成示意图
图16-7-2 2010年国内税收各税种贡献示意图
图16-7-2 2010年国内税收各税种贡献示意图