1993年4月，高新区财政分局成立，作为济宁市财政局的派出机构，接受高新区管委会和市财政局的双重管理，在高新区范围内行使政府财政管理职能，同时作为济宁高新区管委会的财政部门，实行相对独立的区域化管理。
1993—2000年，济宁高新区财政收入以年平均递增48.6%的速度快速发展。2001年，财政收入2.04亿元，较上年同期增长52.7%；2005年，财政收入5.25亿元，较上年同期增长25%。2010年，财政收入15.66亿元，比2005年增加10.05亿元。“十一五”期间，济宁高新区财政收入累计完成53.45亿元，较“十五”期间增加35.13亿元，年平均增长18.38%。财政支出按照“保运转、保稳定、保重点项目”的原则，突出建设型财政特点。在预算执行过程中，统筹安排，合理调配，确保经济和社会事业发展的资金需要。推进支出管理制度改革，控制一般性支出，降低政府运行成本。坚持推行投资评审、部门预算、政府采购和国库集中支付制度改革，不断提高财政资金运营效率。加强重点支出项目管理，2007年，制定印发《济宁高新区管委会关于建立和完善重点支出保障机制的意见》，建立偿债准备金、产业创新发展基金、科技三项基金、高新区孵化基金和企业技术改造资金，对各项专项资金实行专户管理、专款专用，逐步建立起重点突出、覆盖面广、层次分明的财政项目支出管理体系，财政保障能力不断增强。
财源建设
1999—2000年，随着高新区火炬工业园、大学科技园、外商工业园、生物食品园、高科技农业园和个体私营工业园的陆续落地，开发区财政逐步加大对园区基础设施资金投入，推动园区加快发展。“十五”期间，用于城市基础设施建设的投入15.7亿元。其中，预算内投入8.6亿元，通过各种渠道吸附社会资金7亿余元。支持高新区基础设施建设，国家级创业中心、留学生创业园、大学科技园等企业科技创新平台得到迅速发展。2005年，高新区创新基地总孵化面积已达30万平方米，在孵企业200余家。2006年，高新区财政分局完善优惠扶持政策，加大对“高、大、外”项目支持力度，引导企业自主创新，推动产业集聚发展，培植新的经济增长点。2008年，进一步加大对区内重点产业的扶持力度，先后设立“十大创新平台建设”专项资金1000万元，产学研发展专项资金500万元，中小企业偿债周转金3000万元，为区内企业应对经济危机、渡过难关提供资金支持；设立高新区创业引导基金，注册资本5000万元，基金总额2亿元，为区内科技型中小企业特别是高新技术企业提供融资支持，逐步形成高新区可持续发展的财源建设新格局。
财政改革
济宁高新区财政分局坚持把改革作为财政事业发展的总抓手，不断推进综合预算管理改革，大力推行高新区镇办预算外资金管理新模式，实现预算外资金管理新突破。推进政府收支分类改革，全面推行高新区部门预算新方法，从根本上解决预算编制粗放、支出结构不尽合理、部门经费安排苦乐不均等问题。推进农村义务教育经费保障机制改革，2006年起，济宁高新区全部免除农村义务教育阶段的学生学杂费、课本费、辅导费，享受减免的学生达9514人。稳步推进农村合作医疗保障制度改革，逐步建立完善农村新型医疗保障机制。同时加强企业财务、基层财政、政府债务、财政监督检查等方面工作，实现规范化管理。
表16-5-1 1993—2010年济宁高新区财政预算收支统计表
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┃ 单位：万元┃
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┃ 年份 │ 财政总收入 │ 一般预算收入 │ 一般预算支出 ┃
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┃ 1993 │ 1315 │ 1315 │ 1315 ┃
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┃ 1994 │ 1661 │ 797 │ 1568 ┃
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┃ 1995 │ 2407 │ 1333 │ 2160 ┃
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┃ 1996 │ 3969 │ 2577 │ 3478 ┃
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┃ 1997 │ 5087 │ 3329 │ 4301 ┃
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┃ 1998 │ 6792 │ 4080 │ 5210 ┃
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┃ 1999 │ 10092 │ 5916 │ 6745 ┃
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┃ 2000 │ 20031 │ 13358 │ 10480 ┃
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┃ 2001 │ 32147 │ 20359 │ 21937 ┃
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┃ 2002 │ 50082 │ 23284 │ 27700 ┃
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┃ 2003 │ 75002 │ 34571 │ 33345 ┃
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┃ 2004 │ 90761 │ 48815 │ 51300 ┃
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┃ 2005 │ 115554 │ 56139 │ 54907 ┃
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┃ 2006 │ 149302 │ 67367 │ 82215 ┃
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┃ 2007 │ 178303 │ 83651 │ 90281 ┃
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┃ 2008 │ 231626 │ 106519 │ 103220 ┃
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┃ 2009 │ 256803 │ 120366 │ 119868 ┃
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┃ 2010 │ 335890 │ 156635 │ 155960 ┃
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