1991年，全市商办工业企业共29个。其中，肉类加工企业14个，副食品加工企业13个，冷饮企业2个。独立核算单位24个。济宁市商业局直属的商办工业企业有6个。其中，肉类加工企业3个（兖州肉联厂、济宁肉联厂、济宁牛羊加工厂），副食品加工企业2个（济宁市食品厂、济宁市蔬菜副食品公司酿造厂），冷饮企业1个（济宁清华楼）。1992年后，商办工业主管部门围绕企业进入市场这个工作中心，本着政企分开、“宏观要管好，微观要放开”的原则，针对商办工业实际，贯彻执行《全民所有制工业企业转换经营机制条例》，推行企业“一业为主，多种经营”，自主决定生产资料来源、产品品种、数量、销路，自主制定生产计划、决定销售价格，自主经营、自负盈亏、自我发展、自我约束。引导企业积极参与国内、国际市场竞争，注重搞好资源的合理配置和综合利用，发展深加工、精加工，加快商办工业产品结构调整，适应由温饱型向小康型转变的需要，商办工业生产、技术和管理水平上了一个新台阶。1994年，全市食品生产经营企业竞争更趋激烈，商办工业生产经营徘徊不前，市场占有率下降。1995年，在全市范围内实施生猪定点屠宰政策，对食品行业竞争环境有所改善，兖州肉联厂、邹城市肉联厂与俄罗斯建立稳定的贸易关系，外贸出口大幅度增加，全市商办工业销售产值实现29807万元，同比增长18.4%。1996年后，随着商业改革不断深化，生猪定点屠宰在全市全面推行，济宁市商办工业生产经营有所回升。
1997年后，商办工业产销下降，亏损面扩大。兖州肉联厂、济宁市肉联厂、邹城市肉联厂等相继停产。2000年前后，其他肉类加工企业也陆续停产。2010年，市直商业系统已没有商办工业企业。
表14-2-7 1993—2003年济宁市商业系统商办工业主要指标一览表
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┃ 单位：万元┃
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┃ │ 全市 │ 市直 │ 兖州肉联厂 ┃
┃ 年份 ├───────┬───────┼───────┬────────┼───────┬───────┨
┃ │ 工业总产值 │ 工业销售产值 │ 工业总产值 │ 工业销售产值 │ 工业总产值 │ 工业销售产值 ┃
┃ │ （90不变价） │ （现价） │ （90不变价） │ （现价） │ （90不变价） │ （现价） ┃
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┃ 1993 │ 26740 │ 24991 │ 16271 │ 15199 │ 15243 │ 14282 ┃
┠───┼───────┼───────┼───────┼────────┼───────┼───────┨
┃ 1994 │ 22542 │ 26765 │ 11780 │ 15381 │ 10792 │ 13682 ┃
┠───┼───────┼───────┼───────┼────────┼───────┼───────┨
┃ 1995 │ 21776 │ 29807 │ 10749 │ 15725 │ 9988 │ 14802 ┃
┠───┼───────┼───────┼───────┼────────┼───────┼───────┨
┃ 1996 │ 15481 │ 17404 │ 7676 │ 6641 │ 6999 │ 5848 ┃
┠───┼───────┼───────┼───────┼────────┼───────┼───────┨
┃ 1997 │ 12708 │ 16011 │ 4604 │ 3537 │ 4221 │ 3039 ┃
┠───┼───────┼───────┼───────┼────────┼───────┼───────┨
┃ 1998 │ 11625 │ 12787 │ 6125 │ 5082 │ 5829 │ 4632 ┃
┠───┼───────┼───────┼───────┼────────┼───────┼───────┨
┃ 1999 │ 12400 │ 14590 │ 6131 │ 3932 │ 5858 │ 3532 ┃
┠───┼───────┼───────┼───────┼────────┼───────┼───────┨
┃ 2000 │ │ 8733 │ │ 2176 │ │ 2026 ┃
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续表
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┃ │ 全市 │ 市直 │ 兖州肉联厂 ┃
┃ 年份 ├───────┬───────┼────────┬────────┼───────┬──────┨
┃ │ 工业总产值 │ 工业销售产值 │ 工业总产值 │ 工业销售产值 │ 工业总产值 │工业销售产值┃
┃ │ （90不变价） │ （现价） │ （90不变价） │ （现价） │ （90不变价） │ （现价） ┃
┠───┼───────┼───────┼────────┼────────┼───────┼──────┨
┃ 2001 │ │ 5631 │ │ 304 │ │ ┃
┠───┼───────┼───────┼────────┼────────┼───────┼──────┨
┃ 2002 │ │ 4857 │ │ 308 │ │ ┃
┠───┼───────┼───────┼────────┼────────┼───────┼──────┨
┃ 2003 │ │ 8630 │ │ 435 │ │ ┃
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济宁市肉联厂
1991年，全市肉食市场完全放开，市场出现多元主体，国营肉食主体优势逐步丧失，济宁市肉联厂停产。1992年下半年，济宁市肉联厂采取分散经营的方针，成立加工制冷分厂、副食品加工厂、维修车间、加油站等，实行多种经营，开展自救。1994年6月，经市政府协调，市商业局批复成立“济宁市冷冻食品公司”。冷冻食品公司成立后，开展多种经营，实行“生猪定点屠宰”，产品包括生猪、白条肉、分割肉、下货、板油、炼油等。由于“定点屠宰”的猪肉成本高、价格高，市场销售不好，公司实行生猪“定点屠宰”4个多月后停产，部分职工下岗，部分职工停薪留职。此后，济宁市肉联厂生产经营陷于停滞。
济宁市牛羊加工厂
1988年，实现收入565.1万元、纯利润22.5万元。1989年，牛羊肉市场需求增加，主要调往东北三省作为罐头生产厂家的原材料，经过厂家生产加工后，再出口销往苏联。1992年，市食品总公司对牛羊加工厂采取分散突围的经营策略，将其一分为三：原牛羊加工厂背负债权债务；将大部分资产拨付重组为食品公司第二肉联厂，以蛋禽类经营为主；小部分资产拨付重组肉类水产经销公司，以清真肉食和水产品经营为主。1995年，由于第二肉联厂经营不善，被肉类水产经销公司兼并。1996年4月，市食品总公司申请财政扶持资金15万元，在肉类水产经销公司建成日产10吨的制冰车间。1997年，企业自筹资金10万元，扩建20吨制冰车间，产品销往金乡大蒜基地、水产品市场以及化工企业，同时增加了储、代存业务。2000年，由于制冰市场供大于求，企业冷库设备老化，生产经营陷入困境。2002年，肉类水产经销公司将闲置土地进行盘活，部分土地资产变现。2003年，资产全部变现，通过资金运作，实现了资产的保值增值，保障了企业职工的养老及医疗待遇。2003年后，企业未进行任何经营活动。
济宁市食品厂
位于越河北路58号。1990年，由于市场大环境及种种主客观因素影响，企业效益下滑。1992—1994年，四易厂长仍未能使企业生产经营出现转机。1993年，由于生产经营困难，缺乏生产资金，企业处于全面停产状态。1994年初，企业完全走向市场，饼干车间、方便面车间、饮料车间、糖果车间等先后实行承包制，厂方把机器设备和厂房出租给个人，厂方只收取承包租赁费。承包者吃老本、拼设备，不进行新的投资，生产经营缺乏活力，不能完全适应激烈的市场竞争，欠交承包租赁费的现象时有发生。2006年下半年，报请济宁市商业集团总公司批准，决定申报企业破产。2007年8月30日，经济宁市中级人民法院裁定，宣告企业破产，2010年12月10日，破产终结。