企业管理
1991年，全市乡镇企业开展“质量、品种、效益年”活动，对年产值50万元以上企业，加强企业规章制度建设，建立健全企业标准、计量和定额管理，改变企业无章可循、管理混乱状况。全市乡镇企业标准覆盖率86%，三级计量合格企业262家，二级计量合格企业10家；对年产值百万元以上企业，主要以“七基”（计量、标准化、信息、规章制度、定额、班组建设、职工教育）达标为内容，促使企业尽快形成规范化管理。全市共有92家企业通过农业部“七基”管理达标验收，占百万元以上企业总数的21.3%；对年产值500万元以上企业，以现场管理为突破口，推广采用现代化管理方法，引导企业逐步向管理效益型过渡。有25家企业采用1到2种现代化管理方法措施，取得管理效益500多万元。建成邹县金鼎锅厂、兖州城郊造纸厂、泗水金庄造纸厂、市郊区柳行淀粉厂等一批管理效益型示范企业。全市有110家企业获得市级以上先进企业称号。其中，兖州造纸厂跨入国家二级企业行列，4家企业成为部级先进企业，25家企业获得省级系统先进企业称号。
1993年，各县（市、区）人民政府按照农业部《乡镇企业组建和发展企业集团暂行办法》《乡镇企业集团示范章程》，批准并经当地工商行政主管部门注册登记的乡镇企业集团40家，吸纳各类成员企业200家，初步形成年产值20亿元的企业集团群体。1994年，126家企业基础管理达到部颁标准，76家企业获得省级现场管理一级合格证书，18家企业通过三级以上计量验收，7家企业划为中型企业。1995年，根据山东省“管理效益年”活动总体要求，全市乡镇企业坚持以财务管理为中心，以成本管理、资金管理为重点，推进企业由粗放型管理向集约型管理转变。81家乡村企业获农业部基础管理合格证书，20家企业成为二级计量达标单位，60家乡村企业现场管理达到部颁标准，3家企业被授予省级管理示范企业。1996年，曲阜市组织乡村企业学习“邯钢经验”，引入模拟市场核算，实行成本否决管理法。邹城市引进“诸城经验”，在乡村企业中推广“倒逼成本管理”法。任城区向国有大企业改革看齐，抓集团公司的现代企业制度试点。兖州市采取兼容并蓄的做法，探索符合乡镇企业特色的管理新模式，创出“成本目标管理”、“利润含量工资管理”和“销售资金回笼一体化管理法”。全市乡镇办工业实现产销率96%，成本费用利用率6.8%，资金利税率14.8%，资金周转2.39次，工业效益综合指数125%。
2002年，全市民营企业资产500万元以上401家。其中，工业企业过千万元160家，过亿元9家。限额以上工业企业发展到284家。拥有民营企业集团42家。其中，国家级企业集团1家，部级企业集团16家，省级企业集团25家。
企业服务
1992年，济宁市乡镇企业局专门聘请由18人组成的项目论证委员会，帮助企业进行论证，同时为企业提供项目服务。市县两级均建立起项目信息库，收集项目信息1.44万项，被企业选中新上项目688项。1996年，济宁市成立强乡镇管理办公室，加大“强乡带动”战略实施力度，坚持动态管理，对重点集团、规模企业和骨干项目采取每月调度、定期检查，协调有关部门现场办公，加快乡镇企业发展步伐。1999年，市乡镇企业管理局专门成立私营企业管理科，建立私营企业大户档案卡，定期调度生产经营情况，帮助企业解决发展中具体问题。