1991年，济宁化工实验厂（后改为济宁圣城化工实验有限公司）是市直化工企业中唯一农药生产厂家，主要产品为磷化铝、磷化锌。1996年技改后，生产规模达到年产磷化铝1100吨、磷化锌200吨能力，两种产品年出口量均保持在300吨以上。2005年，磷化铝产量539吨（100%），磷化锌产量266吨（100%），出口量分别为153吨和219吨。1990年，济宁化工实验厂一步法合成灭多威粉剂车间建成投产，当年产量15.4吨（90%原药），该成果通过省级技术鉴定，填补国内空白。年生产能力400吨，最高年产量126吨（100%），2004年因环保原因停产。1993年后，陆续开发生产强力保棉威、广杀威、保棉灵、杀虫威、丙铃清、果病灵、桃灵净、虫蛾清等农用乳油制剂新品种。因市场波动、资金制约、产量低等原因，2002年先后停止生产。1995年，丙溴磷乳剂新型农药投产，当年产量15吨，该成果通过省级技术鉴定，填补山东省内空白，产品质量达到国内同类产品领先水平。年生产能力1500吨，最高年产量700吨（100%）。2005年产量87吨（100%）。企业“保粮”牌商标被评为山东省著名商标。截至2010年底，企业可生产杀虫、杀菌剂、农药中间体3个系列10多个牌号产品，成为国家定点农药生产单位、国家粮食储备局认可的粮食熏蒸剂生产单位。2010年，生产各类农药1802吨。其中，磷化铝（100%）1701吨，丙溴磷（100%）151吨。
1991年，泗水县农药厂（创建于1985年，后改制为山东泗水丰田农药有限公司），仅生产杀虫类农药，至2010年底，企业发展到可生产杀虫、杀菌、杀螨、除草3大系列20多个品种。主要产品有25%绿麦隆，40%二莠悬乳剂，5%、10%甲拌辛，3%甲拌磷，25%、50%多菌灵，50%多硫悬浮剂，6.78%阿维达乳油，8%辛毒颗粒剂，3%啶虫醚可湿性粉剂，2.5%高渗吡虫啉乳油和28%多井悬浮剂等。
1991—1995年，济宁市益民化工厂、济宁市通达化工厂等农药生产企业相继建立。济宁市益民化工厂是原化工部磷化铝定点生产厂，农业部首批磷化铝农药登记企业，国家粮食储备局成都粮科所协作厂，“GB5452—2001新标准”起草单位之一。“粮乐”牌磷化铝成为知名品牌产品。2010年，形成年产磷化铝1800吨能力。济宁市通达化工厂从建厂之初仅能生产磷化铝、磷化锌原粉等产品，到2010年发展成为以农药生产为主的综合性化工企业。生产杀虫剂、杀菌剂、除草剂3大系列产品，年产量300吨。
1998年3月，山东山鹰化工有限公司建立，开始生产杀虫剂产品，经过扩能改造，至2010年底，拥有国内先进的气雾剂全自动生产线、蚊香、蝇香全自动生产线，可生产日用气雾剂、蚊香、蝇香、可湿性粉剂、悬浮剂等产品。1998年4月，山东济宁高新技术开发区永丰化工厂建成，开始生产56%磷化铝片剂（仓储宝）、56%磷化铝袋装粉剂（烟厂专用）、85%磷化铝粉剂、80%磷化锌粉剂。采用先进生产设备和工艺技术，按照ISO9000质量管理标准建立有效质量体系。2010年，生产磷化铝（100%）1800吨，产品畅销国内外，远销20多个国家和地区，出口比重达85%以上。
2001年3月，济宁市海洋农化厂成立，开始生产农药产品。2010年，形成年产地虫净10吨，磷化钙6吨生产规模。2004年，山东圣鹏农药有限公司成立，开始生产杀虫、杀螨、杀菌、除草、熏蒸、生物制剂等产品，2010年形成年产农药5000吨生产规模。2010年，生产磷化铝1000吨、联苯菊酯乳油500吨、0.5%香菇多糖水剂600吨。2006年10月，济宁佳丰化工有限公司年产500吨磷化铝生产线建成投产，2010年生产憐化铝420吨。
2010年，全市规模以上农药生产企业10余家，生产化学农药原药（折有效成分100%）2.68万吨。其中，杀虫剂原药9838吨，除草剂原药1.44万吨。
表12-3-2 济宁市部分年份主要农药产品产量一览表
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┃ 单位：吨┃
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┃ 年份 │ 1991 │ 1993 │ 1995 │ 1997 │ 1999 │ 2001 │ 2003 │2005│ 2010 │ 备注 ┃
┃ 产品名称 │ │ │ │ │ │ │ │ │ │ ┃
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┃ 磷化铝（100%） │593.35│ 460.5 │ 568.84 │ 1009 │ 841.06 │ 734.27 │501.541 │539 │ 6325 │ ┃
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┃ 磷化锌（100%） │ 25.5 │ 13.56 │ 24.82 │106.46│ 131.06 │ 130.21 │ 23134 │266 │ 305 │ ┃
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┃ 灭多威（100%） │71.23 │ 209.93 │ 126.15 │ 1.63 │ 14.96 │ 3.03 │ 6.65 │ — │ — │ 2004年停产 ┃
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┃ 强力保棉威（实物） │ — │ 74.6 │ 240.5 │ — │ — │ — │ — │ — │ — │ 1997年停产 ┃
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┃ 广杀威（实物） │ — │ — │ 54.9 │ — │ — │ — │ — │ — │ — │ 1997年停产 ┃
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┃ 杀虫威（实物） │ — │ — │ 72.23 │ — │ — │ — │ — │ — │ — │ 1997年停产 ┃
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┃ 保棉灵（实物） │ — │ — │ 34.05 │ — │ — │ — │ — │ — │ — │ 1997年停产 ┃
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┃ 丙灵清（实物） │ — │ — │ 22.37 │ — │ — │ — │ — │ — │ — │ 1997年停产 ┃
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┃ 丙溴磷（100%） │ — │ — │ 15.09 │38.06 │ — │ 37.4 │ 242.95 │ 87 │ 151 │ ┃
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┃ 果病灵（100%） │ — │ — │ — │ — │ 18.53 │ — │ — │ — │ — │ 2001年停产 ┃
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┃ 桃灵净（40%） │ │ │ │ │ │ 37.3 │ — │ — │ — │ 2002年停产 ┃
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┃ 虫蛾清（20%） │ │ │ │ │ │ 75.6 │ — │ — │ — │ 2002年停产 ┃
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┃ BT杀虫剂 │ │ 33.3 │ 352.8 │ │ │ — │ — │ — │ — │ 1997年停产 ┃
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