1991年，济宁市机械工业公司为全市机械行业主管部门，正县级行政级别。设办公室、组织科、宣传科、生产调度科、计划基建科、财务科、审计科、企业管理科、科技科、职工教育科、劳资安全科、工会、保卫科、武装部和团委15个科室。全系统工业企业46户，其中市直企业25户。非工业企业单位5个，即济宁市机械设计院、济宁市农副产品加工机械研究所、济宁市液压元件研究所、济宁市机械工业供销公司、济宁市机械工业服务公司。
2001年6月，济宁市机构改革，撤销济宁市机械工业公司、市电子工业公司、市建材工业公司、市汽车工业公司，组建济宁市机械电子工业办公室。行使济宁市机械、电子、建材工业的行业管理职能，指导市属机械、电子、建材企业改革和管理的职责。设综合科、经济运行科、规划发展科、企业科、离退休干部科5个科。
2006年，成立济宁市信息产业局，将济宁市机械电子工业办公室承担的机械、电子、建材工业的管理职能，指导市属机械、电子、建材企业改革和管理的职责，并入市信息产业局；将市信息化工作领导小组办公室的行政职能，并入市信息产业局；将市通信、广播电视、计算机网络及其他专用通信网络规划建设方面的行政职能划入市信息产业局。市信息产业局设办公室、信息化推进科、信息网络管理科、信息产业管理科、机械建材行业管理科、人事教育科6个科室，由机械建材行业管理科行使济宁市机械工业的行业管理职能。
2010年4月，济宁市政府机构改革，设立济宁市经济和信息化委员会（挂济宁市中小企业局牌子），为市政府工作部门。内设办公室、人事科（挂离退休人员服务科牌子）、研究室、产业政策科（挂行政许可科牌子）、经济运行办公室、规划与技术改造办公室、科技科、企业科（挂对外合作与交流科牌子）、交通与物流科（挂市道口管理办公室牌子）、电力科、机械建材冶金工业科、行业发展科、电子信息科、软件和信息服务科、信息化推进科、电子政务与信息网络管理科、市政府节约能源办公室、新能源办公室、中小企业综合科、中小企业政策科、中小企业发展科、中小企业科技科22个科室。