疫病调查
1991年，济宁市按照国家《关于开展全国畜禽疫情普查的通知》要求，先行在任城区普查试点，随后在12县（市、区）开始畜禽疫情调查和历史疫情资料整理统计。根据普查结果，全市畜禽传染病20余种、寄生虫病10余种。
表6-4-1 济宁市畜禽主要传染病种类表
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┃ 畜禽类别 │ 传染病名称 ┃
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┃猪 │猪瘟、猪丹毒、仔猪副伤寒、猪传染性胃肠炎、猪乙型脑炎、猪链球菌病、猪水肿病、仔猪红黄白痢 ┃
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┃家禽 │鸡新城疫、禽霍乱、鸡马立克氏病、鸡白痢、鸡传染性支气管炎、鸡传染性法氏囊炎、鸡瘟、鸡大肠杆菌病、鸭瘟、小┃
┃ │鹅瘟 ┃
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┃大家畜（马、骡、驴、牛） │牛传染性角膜炎、布氏杆菌病、破伤风 ┃
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┃羊 │布氏杆菌病、羊肠毒血症、破伤风 ┃
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┃家兔 │兔葡萄球菌病、兔巴氏杆菌病、兔出血性败血症、兔螺旋体病 ┃
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┃犬猫 │狂犬病、犬瘟热、猫传染性肠炎 ┃
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┃水貂 │阿留申病、犬瘟热、巴氏杆菌病 ┃
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┃人畜共患病 │布氏杆菌病、狂犬病、口蹄疫、破伤风、结核病 ┃
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表6-4-2 济宁市主要畜禽寄生虫病种类表
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┃ 畜禽类别 │ 寄生虫病名称 ┃
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┃猪 │猪囊虫病、猪蛔虫病、猪肺丝虫病 ┃
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┃家禽 │鸡蛔虫病、鸡绦虫病、鸡球虫病 ┃
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┃大家畜（马、骡、驴、牛） │牛疥癣 ┃
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┃羊 │羊疥癣、羊肝片吸虫病 ┃
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┃家兔 │兔球虫病 ┃
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疫病发生流行
畜禽传染病 20世纪90年代后，国家防治畜禽传染病法律法规不断健全和完善，畜禽规模化饲养不断提高，农民防病知识不断加强，一些危害畜牧业发展的畜禽传染病，特别是曾经在全市大流行的猪瘟、鸡新城疫得到有效控制。随着对外开放扩大，国际、国内畜禽及其产品贸易不断增大，流动频繁，加之兽用疫苗的推广应用，以及病毒对环境的适应能力增强，一些新的畜禽传染病不断发生，如猪细小病毒病、猪蓝耳病、鸡传染性法氏囊炎、鸡产蛋下降综合症等。畜禽疫病由过去的单一病毒感染向多个病毒、细菌混合感染方向发展，加大了防治难度。流行方式由过去的疫情暴发到温和性零星散发为主。2006—2010年，全市猪丹毒、猪肺疫、兔瘟等得到有效控制。
畜禽寄生虫病 1991年，济宁市根据山东省畜牧兽医总站修订的《畜禽寄生虫检验操作规程》，在全市全面开展调查，初步摸清畜禽寄生虫种类、分布区域和感染程度。全市共查出并鉴定畜禽寄生虫50余种，对流行范围较广、危害严重的寄生虫病如猪蛔虫病、猪肺丝虫病、牛羊肝片吸虫病、疥癣、鸡蛔虫病、鸡绦虫病、鸡兔球虫病等，经过连年普遍驱治和改善饲养环境，畜禽寄生虫平均感染率降低到5%左右，单纯由寄生虫引起的畜禽疫病感染率不到2%。
疫病控制
1996年，济宁市达到马鼻疽国家消灭标准，并通过验收。2004年，达到马传染性贫血病国家消灭标准，并通过验收。尚在流行或散发的主要畜禽疫病有猪瘟、猪丹毒、仔猪红黄白痢、鸡新城疫、禽霍乱、鸡传染性法氏囊炎、鸡瘟、狂犬病、兔出血性败血症等。经多年防治，2005—2010年，猪瘟、鸡新城疫发病率逐年降低。
畜禽疫苗
1994年起，济宁市对符合兽用生物制品经营条件的13个单位，发放省畜牧局《兽用生物制品经营许可证》，有效期5年，每5年换发1次。年初，山东省畜牧局根据各市上年度畜禽存栏量，下达畜禽疫苗计划，济宁市畜牧部门根据各县（市、区）畜禽存栏量，再进行畜禽疫苗计划分配。20世纪90年代后，畜禽饲养量增加，预防猪瘟、猪丹毒、鸡新城疫所用疫苗补贴相对较少，多依靠市场苗供应。1991—2005年，根据全市畜禽疫情和疫苗生产供应情况，先后推广应用疫苗25种。2005年后，强制免疫疫苗种类有所改变，禽类增加禽流感—新城疫重组二联活疫苗；口蹄疫减少常规佐剂苗，全部换为高效佐剂苗；牛增加口蹄疫A型苗。2007年，猪增加高致病性蓝耳灭活苗。2008年，增加猪瘟苗。2009年，增加高致病性蓝耳活苗。
疫病防治体系
疫情收集 1999年，根据农业部《动物疫情报告管理办法》，济宁市建立疫情报告制度，在发生一类或疑似一类动物疫情，二类、三类或者其他动物疫病呈暴发流行，新发现的动物疫情，已消灭又发生的动物疫病时，县级动物防疫监督机构和国家测报点确认发生上述动物疫情后，在2小时内按程序报省动物防疫监督机构和所在地兽医主管部门。同时通报疫区的邻接地区。
疫情监测 济宁市设立国家级疫情监测点嘉祥县1处；省级疫情监测点金乡县、邹城市和曲阜市3处。主要对畜禽传染病、寄生虫病进行监测。建立监测点的县市畜牧兽医站由农业部或省投资建立兽医化验室，以县畜牧兽医站为单位设立监测点。每年向省市兽医站填寄《兽医监测信息》，对重大疫情随时报告。
防疫措施 主要采取行政、技术、群众三结合，预防注射为主的综合性防治措施。根据畜禽疫病性质、特点、流行范围、危害程度，采取相应控制与消灭措施。20世纪90年代，由于畜禽饲养以分散饲养为主，养殖户防疫技术知识薄弱，在全市推行畜禽防治技术承包和防治岗位责任制，由乡镇畜牧兽医站与当地政府签订畜禽防疫技术承包合同，当地政府根据每年承包合同完成情况，拨付给乡镇畜牧兽医站一定数额承包费。1996年，全市实行防治技术承包的有174处乡镇，6210个村，占行政村总数的97%；猪发病死亡率下降到0.05%；鸡下降到0.5%。2005年，全市猪瘟、猪丹毒发病死亡率下降到0.01%、0.005%，鸡下降到0.2%。
防疫体系建设 20世纪90年代初，因乡镇机构改革，“三权”下放，即乡镇畜牧兽医站仅接受县级畜牧部门业务领导，乡镇畜牧兽医站承担当地防疫、检疫、服务多项职能。90年代后期，全市推行执法和服务分离的管理新体制，乡镇畜牧兽医站不再承担检疫职能。县级畜牧部门成立防疫监督机构，承担全县畜禽检疫监督职能。2004年，全市12个县（市、区）全部实现执法与服务相分离，成立12处县级防疫监督分所、32处防疫检疫分所。2007年，市政府印发《关于兽医管理体制改革的意见》。建立健全市县两级行政管理、执法监管、技术服务三大体系。加强镇动物防疫机构建设。各县（市、区）根据工作需要，按乡镇或区域设立畜牧兽医站。凡饲养畜禽的村庄，原则上聘任1名动物防疫员，协助做好动物防疫、检疫、疫情报告、畜牧生产、畜牧统计等工作。村级动物防疫员由县（市、区）畜牧兽医行政管理机构管理和组织技能培训。根据所承担任务的轻重和任务完成情况，给予村级动物防疫员一定误工补贴。
重大动物疫病防控
2004年2月，市政府成立以市长为指挥长的济宁市重大动物疫病防治指挥部，各县（市、区）也成立相应工作机构。2009—2010年，济宁市连续两年被评为全省重大动物疫病防控工作先进市。
口蹄疫 20世纪90年代后期，国家动物防疫法规逐步健全和完善，口蹄疫疫苗研制成功并逐步推广应用。2005年起，全市猪采用O型口蹄疫疫苗免疫注射。牛羊采用O—亚Ⅰ型二联口蹄疫疫苗。疫苗补贴为中央、省负担60%，市、县各负担20%。1999—2010年，口蹄疫未在全市发生和流行。
禽流感 2004年，禽流感在国内部分地区发生和流行。全市开始推广禽流感疫苗免疫注射。2008年，家禽高致病性禽流感使用禽—新二联疫苗、H5N1疫苗。疫苗补贴为中央负担20%，剩余部分由省、市、县各负担三分之一。至2010年，全市未发生禽流感疫情。
猪瘟、高致病性猪蓝耳病 2007年，国家将高致病性猪蓝耳病纳入国家强制免疫。2008年，将猪瘟纳入强制免疫范畴。2009年，增加高致病性蓝耳活苗。疫苗补贴政策为中央、省负担50%，市、县各负担25%。至2010年，全市未发生猪瘟、高致病性猪蓝耳疫情。
重大动物疫病防控演练 （2005年12月摄）
兽医器械
20世纪90年代，全市兽医器械变化不大，基本上以刀子、剪子、连续注射器等为主。2000年后，国家加大防疫基础设施投资力度，兽医化验室设备有了很大改进。2003年，济宁市本级、泗水县列入农业部动物防疫基础设施项目建设，中央拨付资金100万元，用于防疫基础设施建设。2008年，市政府投入400万元，建设市级畜产品质量安全监测中心，2009年正式运行。2010年，对59个重点乡镇、97个养殖专业村建设冷链体系。“十一五”期间，累计完成12个县（市、区）、145个乡镇防疫基础设施改扩建，为科学防控、依法防控奠定了坚实基础。