济宁市经济作物资源丰富。1990年前，全市经济作物有棉花、油料（花生、芝麻、蓖麻籽、油菜籽）、麻类（大麻、苘麻、红麻）、甜叶菊、甜杆（甘蔗的一种）、甜菜、烟草（烤烟、晒烟）、药材等。1990年后，甜菜、甜杆、蓖麻、苘麻、大麻仅零星种植。1991年，经济作物播种面积17.29万公顷，占当年全市农作物播种面积的18.81%。之后，受棉花种植面积下降的影响，1998年，全市经济作物播种面积8.5万公顷，仅占当年农作物播种面积的8.97%。1999年后，全市经济作物播种面积随着棉花播种面积的增大逐年回升。2005年，全市经济作物播种面积17.94万公顷，占全市当年农作物播种面积的17.39%。2010年，全市经济作物播种面积40.4万公顷，占全市当年农作物播种面积的37.9%。
棉花
90年代后，由于农业种植结构调整力度加大，棉花种植面积逐步向种植基础较好的金乡、嘉祥、鱼台、汶上、梁山5县集中。
2003年，5县植棉面积9.47万公顷，占全市植棉面积的95.14%。1997年后，棉花种植方式进一步优化，在金乡、鱼台、嘉祥南部（蒜套区）一体化种植的基础上，汶上、梁山和嘉祥北部（麦套区）重点推广地膜覆盖技术，5个重点产棉县形成南钵北膜的种植格局。2003年，钵、膜棉面积占全市总面积的91.6%，套种方式由20世纪80年代至90年代初的麦套棉为主，转变为1995年后蒜（圆葱）、瓜菜、薯为主。
1992年，全市先旱后涝，黄枯萎病和棉铃虫交替发生，棉花歉收。当年植棉面积12.7万公顷，亩产皮棉49.26公斤。1993年，全市棉铃虫大爆发，棉花严重减产，平均亩产皮棉仅31公斤，最严重的嘉祥县仲山乡，基本绝产。1992—1995年，国家三次提高棉花收购价格，但农药、化肥、农膜等农用物资涨价幅度较大，特别是防治棉花黄枯萎病、棉铃虫用药成本剧增，棉花经济效益降至最低点。1999年，全市棉花种植面积仅3.17万公顷，比1991年减少330%。2000年后，随着转基因抗虫棉普及，特别是高产优质抗虫杂交棉花品种不断更新，纤维品质逐年提高，棉花生产发展迅速。2003年，全市植棉面积9.95万公顷，比1999年增加213.85%，比2002年植棉面积5.81万公顷增加71.32%。2004年后，棉花播种面积均保持10万公顷以上。2008年，全市棉花种植面积达到11.95万公顷，皮棉亩产92.4公斤，总产16.56万吨，皮棉单产为历史最高水平。
嘉祥县万亩抗虫棉基地一角 （1991年摄）
麻类 济宁苘麻、大麻种植面积较少，绝大多数为红麻。主要分布在嘉祥、梁山县。1991—2002年，红麻常年种植面积1500～2500公顷。1995年，全市麻类种植面积1996公顷，亩产达到373.53公斤，总产1.12万吨，单产、总产均创历史最高水平。2003年，全市麻类种植面积1099公顷，嘉祥、梁山两县种植1060公顷，占全市麻类种植面积的96.45%。2004年后，种植面积大幅度下降，并由大田向沟头地边、涝洼地转移。当年种植466公顷，2005年下降到345公顷，2006年种植面积下降到234公顷，2008年种植面积仅为56公顷，2009年后鲜见种植。 油料 1991年，全市油料作物播种面积3.31万公顷，占经济作物播种面积的19.15%。其中，花生播种面积3.17万公顷，占油料作物播种面积的95.85%；芝麻、油菜籽播种面积占4.15%。2003年，油料作物播种面积6.57万公顷，其中花生播种面积6.49万公顷，占油料作物播种面积的98.92%，主要分布于邹城、泗水、汶上、梁山等县市。芝麻播种面积703公顷，占油料作物播种面积的1%，主要分布于梁山、邹城、嘉祥等县市的丘陵及旱薄地。油菜籽播种面积31公顷，仅占油料作物播种面积的0.08%，除梁山县有零星种植外，主要分布于微山县南部。 90年代后，由于地膜覆盖栽培技术的普及推广，花生优质高产品种不断更新，花生单产、总产不断提高。1994年，花生播种面积5.81万公顷，亩产267.2公斤，总产23.3万吨。1995—1999年有所波动，2000年花生播种面积迅速发展到6.05万公顷；2005年，花生播种面积达6.63万公顷，亩产297.8公斤，总产29.6万吨，花生播种面积、总产均创历史最高水平。2009—2010年，全市花生的栽培面积显著下降，年均在4.8万公顷上下。 烟草 济宁市烟草主要为烤烟、晒烟两种。随着兖州卷烟厂的停产，全市烤烟种植面积直线下滑。1991年，全市烤烟种植面积430公顷，比1978年的3013公顷下降85.73%。1995年，烟草种植面积仅4公顷，且多为晒烟，在曲阜、兖州、邹城等地有零星种植。1997年，烟草种植面积恢复到100公顷，2001年迅速下降到4公顷。2007年，烟草种植面积下降到1公顷。2010年后鲜见种植。 甜叶菊 种植主要分布在任城区，1986年开始引种，1987—1997年面积逐年扩大。 任城区万亩甜叶菊 （2005年6月摄）
1989—1994年，南张镇仙庄村引种成功后，周边村、镇相继开始零星种植，后随着甜叶菊加工企业——华仙甜叶菊糖厂建成投产，甜叶菊种植面积逐渐扩大。1994年，任城区南张镇甜叶菊面积发展到近600公顷，亩产150～200公斤，高产田达每亩300公斤。1995—1997年，随着国际市场的进一步拓展，出口量增加，菊叶收购价格提升，甜叶菊种植效益显著提高，每公顷纯收入达3万多元，甜叶菊生产快速发展。1995年，种植面积发展到1000公顷，1996年为2333公顷，1997年达到5333公顷，甜叶菊亩产达270公斤，高产田达350公斤。1997年，任城区南张镇被国家命名为“中国甜叶菊之乡”。1998—2001年，由于甜叶菊糖产品受国际市场影响，尤其受东南亚经济危机影响，价格大幅下跌，导致甜叶菊种植面积直线下滑，每年种植面积仅有200公顷左右。2002—2005年，随着甜叶菊国际市场形势好转，加上一些低倍糖产品研制成功，拓展了应用领域和范围，国际、国内市场需求增加，甜叶菊种植热度提升。2002年，种植面积达到800公顷，2003年达到1867公顷，2004年2333公顷，2005年3667公顷，甜叶菊亩产达300～325公斤，高产田达到400公斤。华仙、华元、奥星、运河等甜菊糖加工企业，年产甜菊糖120万公斤，年出口量占全国出口总量的70%以上，成为全国最大的甜叶菊生产、加工、出口基地。
麻类 济宁苘麻、大麻种植面积较少，绝大多数为红麻。主要分布在嘉祥、梁山县。1991—2002年，红麻常年种植面积1500～2500公顷。1995年，全市麻类种植面积1996公顷，亩产达到373.53公斤，总产1.12万吨，单产、总产均创历史最高水平。2003年，全市麻类种植面积1099公顷，嘉祥、梁山两县种植1060公顷，占全市麻类种植面积的96.45%。2004年后，种植面积大幅度下降，并由大田向沟头地边、涝洼地转移。当年种植466公顷，2005年下降到345公顷，2006年种植面积下降到234公顷，2008年种植面积仅为56公顷，2009年后鲜见种植。 油料 1991年，全市油料作物播种面积3.31万公顷，占经济作物播种面积的19.15%。其中，花生播种面积3.17万公顷，占油料作物播种面积的95.85%；芝麻、油菜籽播种面积占4.15%。2003年，油料作物播种面积6.57万公顷，其中花生播种面积6.49万公顷，占油料作物播种面积的98.92%，主要分布于邹城、泗水、汶上、梁山等县市。芝麻播种面积703公顷，占油料作物播种面积的1%，主要分布于梁山、邹城、嘉祥等县市的丘陵及旱薄地。油菜籽播种面积31公顷，仅占油料作物播种面积的0.08%，除梁山县有零星种植外，主要分布于微山县南部。 90年代后，由于地膜覆盖栽培技术的普及推广，花生优质高产品种不断更新，花生单产、总产不断提高。1994年，花生播种面积5.81万公顷，亩产267.2公斤，总产23.3万吨。1995—1999年有所波动，2000年花生播种面积迅速发展到6.05万公顷；2005年，花生播种面积达6.63万公顷，亩产297.8公斤，总产29.6万吨，花生播种面积、总产均创历史最高水平。2009—2010年，全市花生的栽培面积显著下降，年均在4.8万公顷上下。 烟草 济宁市烟草主要为烤烟、晒烟两种。随着兖州卷烟厂的停产，全市烤烟种植面积直线下滑。1991年，全市烤烟种植面积430公顷，比1978年的3013公顷下降85.73%。1995年，烟草种植面积仅4公顷，且多为晒烟，在曲阜、兖州、邹城等地有零星种植。1997年，烟草种植面积恢复到100公顷，2001年迅速下降到4公顷。2007年，烟草种植面积下降到1公顷。2010年后鲜见种植。 甜叶菊 种植主要分布在任城区，1986年开始引种，1987—1997年面积逐年扩大。 任城区万亩甜叶菊 （2005年6月摄）
1989—1994年，南张镇仙庄村引种成功后，周边村、镇相继开始零星种植，后随着甜叶菊加工企业——华仙甜叶菊糖厂建成投产，甜叶菊种植面积逐渐扩大。1994年，任城区南张镇甜叶菊面积发展到近600公顷，亩产150～200公斤，高产田达每亩300公斤。1995—1997年，随着国际市场的进一步拓展，出口量增加，菊叶收购价格提升，甜叶菊种植效益显著提高，每公顷纯收入达3万多元，甜叶菊生产快速发展。1995年，种植面积发展到1000公顷，1996年为2333公顷，1997年达到5333公顷，甜叶菊亩产达270公斤，高产田达350公斤。1997年，任城区南张镇被国家命名为“中国甜叶菊之乡”。1998—2001年，由于甜叶菊糖产品受国际市场影响，尤其受东南亚经济危机影响，价格大幅下跌，导致甜叶菊种植面积直线下滑，每年种植面积仅有200公顷左右。2002—2005年，随着甜叶菊国际市场形势好转，加上一些低倍糖产品研制成功，拓展了应用领域和范围，国际、国内市场需求增加，甜叶菊种植热度提升。2002年，种植面积达到800公顷，2003年达到1867公顷，2004年2333公顷，2005年3667公顷，甜叶菊亩产达300～325公斤，高产田达到400公斤。华仙、华元、奥星、运河等甜菊糖加工企业，年产甜菊糖120万公斤，年出口量占全国出口总量的70%以上，成为全国最大的甜叶菊生产、加工、出口基地。