1994年，市政府残疾人工作协调委员会成立，33个部门为成员单位，主要职责是综合协调有关残疾人事业方针、政策、法规、规划、计划的制定与实施工作，协调解决残疾人工作中的重大问题。具体工作由市残联承担，委员会秘书处设在市残联办公室。2006年，经市政府批准，市政府残疾人工作协调委员会更名为市政府残疾人工作委员会，成员部门增至37个，机构的主要职责、工作制度等不变。各级人大、政协定期组织实施《残疾人保障法》的执法检查、工作视察，推动残疾人法律法规贯彻执行。
2000年底，市、县、乡三级残疾人组织框架初步形成，全市12个县级残联全部达到规格正科、计划单列、理事长专职的要求，乡镇（街道）普遍成立残联，机构设置基本完善。2009年底，全市93个乡镇（街道）残联配备专职理事长，156个乡镇（街道）以公益性岗位形式全部选聘残疾人专职干事，6220个村（社区）全部落实残疾人专职委员，初步建立起以县（市、区）残联为主导、乡镇（街道）残联为骨干、村（社区）残疾人协会为基础的基层残疾人组织网络。市、县两级各自按要求成立盲人协会、聋人协会、肢残人协会、智力残疾人及亲友协会、精神残疾人及亲友协会5个残疾人专门协会。协会工作机制进一步健全和完善。
2010年，济宁市残疾人联合会机关设办公室（挂市政府残疾人工作协调委员会秘书处牌子）、组织联络维权部、康复部、教育就业部（挂市残疾人劳动就业办公室牌子）、宣传文体部5个部室，编制19人。
第一节 组织建设
视图
1994年，市政府残疾人工作协调委员会成立，33个部门为成员单位，主要职责是综合协调有关残疾人事业方针、政策、法规、规划、计划的制定与实施工作，协调解决残疾人工作中的重大问题。具体工作由市残联承担，委员会秘书处设在市残联办公室。2006年，经市政府批准，市政府残疾人工作协调委员会更名为市政府残疾人工作委员会，成员部门增至37个，机构的主要职责、工作制度等不变。各级人大、政协定期组织实施《残疾人保障法》的执法检查、工作视察，推动残疾人法律法规贯彻执行。
2000年底，市、县、乡三级残疾人组织框架初步形成，全市12个县级残联全部达到规格正科、计划单列、理事长专职的要求，乡镇（街道）普遍成立残联，机构设置基本完善。2009年底，全市93个乡镇（街道）残联配备专职理事长，156个乡镇（街道）以公益性岗位形式全部选聘残疾人专职干事，6220个村（社区）全部落实残疾人专职委员，初步建立起以县（市、区）残联为主导、乡镇（街道）残联为骨干、村（社区）残疾人协会为基础的基层残疾人组织网络。市、县两级各自按要求成立盲人协会、聋人协会、肢残人协会、智力残疾人及亲友协会、精神残疾人及亲友协会5个残疾人专门协会。协会工作机制进一步健全和完善。
2010年，济宁市残疾人联合会机关设办公室（挂市政府残疾人工作协调委员会秘书处牌子）、组织联络维权部、康复部、教育就业部（挂市残疾人劳动就业办公室牌子）、宣传文体部5个部室，编制19人。