篮球
济宁市篮球队隶属济宁市体校，代表济宁市先后参加16-22届省运会；在第十九届省运会篮球比赛中，济宁男子篮球队进入决赛。
足球
济宁市女子足球队隶属济宁市体校，代表济宁市先后参加16-22届省运会均进入决赛，涌现出一大批优秀女足球运动员。1992年，济宁籍运动员李秀红、杜鹃、林霞、史淑寒代表山东队在“美媛春杯”全国女子青年足球比赛中获冠军。1997年9月，济宁籍运动员祝晓璐、任芳、蔡敬玲、吴桂华、苏风梅代表山东队参加在济南举办的国际女足比赛，获冠军。
济宁九巨龙足球俱乐部1999年11月，山东省足球联赛资格赛在东营举行，当年组队的济宁巨龙足球队参加全部六场比赛，先后以7∶0胜青岛队，0∶0平济南队，7∶2胜省体校队，2∶2平胜利油田队，12∶0胜东营队，2∶0胜淄博队，以六战四胜两平的不败战绩荣膺山东省足球联赛资格赛冠军，并取得参加2000年全国足球乙级联赛资格。2000年5月20日，济宁巨龙足球队参加全国乙级联赛第一场比赛，以4∶0胜宁夏圣雪绒足球队。2001年，济宁巨龙足球队更名为九巨龙足球队。中国足协在广西梧州举办的2001年全国U-21青年联赛选拔赛上，济宁九巨龙力挫青岛海牛、云南红塔、四川全兴、北京龙力等，进入六强，首次参赛获第五名。2002年，九巨龙俱乐部内引外联，优化组合，聘请具有丰富执教经验的主教练刘启璞，同时从江苏无锡法尔胜俱乐部引进6名有实力的球员。在当年的比赛中，提前一轮打进复赛，最后以一分之差痛失决赛权，在全国17支乙级队中排名第九。2003年，九巨龙足球俱乐部又从山东鲁能、上海中远等俱乐部引进数名球员，球队实力有明显提高。九巨龙足球俱乐部从赛季一开始就力争每场比赛的胜利，最终，以6战3胜2平1负积11分的成绩，提前两轮小组出线，获得2003年全国足球乙级联赛复赛资格。2003年，九巨龙足球俱乐部出售。