2000年，济宁市被列为全省国民体质重点监测的4个地市之一，并在济宁举办有临沂、枣庄、日照、菏泽、济宁5市参加的体质监测培训班，济宁市承担3～69岁4000个样板量的监测任务。监测分城乡两方面人群，按性别分为4类样本、16个年龄段。监测任务重，要求高，济宁市投入大量的人力、物力、财力，历时2个月紧张工作，圆满完成任务。
2005年，市体育局按照省体育局等十局厅《关于开展2005年山东省国民体质监测工作的通知》要求，开展第二次国民体质监测工作。省体育局等十局厅《关于开展2005年山东省国民体质监测工作的通知》下发后，济宁市制定下发《2005年济宁市国民体质监测工作方案》，成立国民体质监测领导小组，下设办公室，组建由31人组成的国民体质监测队。3月30日至4月3日，选派6名业务素质好、接受能力强、参加过2000年国民体质监测工作的人员参加省体育局组织的培训班。5月18-20日，以参加过培训的6人为骨干，聘请市有关专家为指导，对其他25名工作人员进行系统培训。市体育局拨出10万元经费专项用于国民体质监测。本次监测采取整群随机抽样的方法，历时3个月，先后在市中区、任城区和邹城市14个监测点的城乡居民中进行监测，实际监测4793人，检验出4536个有效样本，获取78590个有效数据，整理上报省体育局，并写出专题论文和2005年济宁市国民体质监测报告。
2010年，组织第三次国民体质监测。年初，市体育局联合市教育局、市科技局、市财政局、市统计局共同制定印发《关于开展2010年济宁市国民体质监测工作的通知》，成立2010年济宁市国民体质监测工作领导小组，制定2010年济宁市国民体质监测工作方案，6月3-4日，组织30名高级技术学校学生进行监测前培训，6月5日开始，在任城区和市中区，深入农村、社区、机关、事业、工厂车间开展国民体质监测工作，共监测人员4000多人，并对200多人进行复测，提取上报3240个有效样本。由于工作突出，济宁市被省体育局授予优秀组织奖。