1991-2001年，贯彻宣传《尘肺病防治条例》《乡镇企业劳动卫生管理办法》等法规制度，进行乡镇以上厂矿企业卫生服务需求调查，开展农药中毒防治宣传工作。各县（市、区）举办学习班，组织相关人员进行学习，同时利用广播、电视、报纸进行宣传。完成3万余名职工的职业健康查体工作，并建立职业健康档案。加强企业粉尘毒物、噪声、高频作业点的监测，覆盖率96%，存在问题较为严重的企业下达处罚决定书，限期整改。2002年，市卫生局制定印发《职业病防治法宣传活动方案》，联合市安监局、市总工会等部门组织开展“4·25”职业病防治宣传周活动。对65个厂矿企业、1122个有害作业点进行检测，对3426名职工进行健康检查，健康档案建档率100%。2003-2005年，对存在职业病危害因素的400多个厂矿企业进行了经常性卫生监督，对2家企业进行警告，对27家企业进行行政处罚。监测厂矿企业56厂次，监测有害作业点492个。对接触职业病危害因素的5000余人次进行健康查体，职业健康监护率100%，诊断慢性苯中毒患者3例，慢性苯中毒观察对象6例，慢性铅中毒观察对象30例，高频听力损伤2例，向所在单位下发处理意见或《调离通知书》。2006-2009年，全市共组织5万多人次进行职业健康体检，发现职业禁忌症患者2000多人，疑似职业病患者200多人。实施职业卫生“四个一”工程，印制全市统一的落实职业病防治法责任书和职业卫生管理体系档案。2010年，市政府印发《济宁市职业病防治规划（2010-2015年）》。