“普九”工作
1990年，全市有小学4225所，在校生764231人，平均每校181人；初中479所，在校生261222人，平均每校545人。小学适龄儿童入学率98%，最低的县为91.47%；初中入学率69.4%，最低的县为53.4%。小学、初中教师学历达标率分别为77.91%、44.37%；生均公用经费初中10.24元，小学1.08元。
1991年，市政府颁布《关于实施义务教育的意见》，市委、市政府下发《关于改革和加强全市教育工作的决定》等一系列文件，各县市区按照规定的法律程序宣布实施九年制义务教育，并加强保障制度建设。1991年11月7日，市政府在兖州召开实施义务教育现场经验交流会，推动“普九”实施。1993年12月，城镇校改工作通过省政府验收，城镇校改全市四年共投资3亿元，新建校舍74.5万平方米，使城镇中小学基本达到“普九”标准。1994年10月28日，市中区的“普九”工作通过省政府评估验收，率先在济宁市基本普及九年制义务教育。11月，市委、市政府召开全市教育工作会议，市委书记王修智代表市委、市政府与12个县市区主要负责人签订实现“基本普及九年制义务教育、基本扫除青壮年文盲”即“两基”目标责任书，全市“普九”工作重点由城镇转向农村。
1995年，全市加大“普九”力度，4月10日，市政府召开义务教育工作调度会，客观分析全市“普九”形势，对加快“普九”步伐作出全面安排。市委办公室、市政府办公室下发《关于多渠道筹措教育经费有关问题的通知》，解决教育投入不足问题。11月2日，兖州市通过省政府“两基”工作评估验收，基本普及九年制义务教育。1996年4月，市政府在微山县召开全市第二次义务教育现场会，加快实施“普九”步伐。是年，曲阜市、邹城市、任城区先后通过省政府“两基”验收，基本普及九年制义务教育。1997年1月，微山县、金乡县、泗水县的“两基”工作通过省政府评估验收，完成“普九”任务。同年12月21日，汶上县通过省政府“两基”评估验收，完成“普九”任务。
1999年，市政府向梁山、嘉祥、鱼台三县拨付400万元“普九”专项资金，在春节前又安排1000万元调度款，用于解决拖欠教师工资。在东营、德州、临沂三市和全市九县市区的对口支援下，同年6月，嘉祥、梁山、鱼台三县通过省政府“两基”验收。至此，全市12个县市区全部实现“两基”，完成普及九年制义务教育任务。
巩固发展
全市“普九”工作通过省政府评估验收后，1999年8月18日，市政府办公室下发《关于进一步做好“两基”巩固提高工作的通知》，要求各县市区继续完善“普九”动态监控机制和贫困学生助学机制。“两区三市”实施“双高普九”，其他县抓“普九”的巩固和提高。2003年，市政府出台《济宁市中小学校舍安全责任追究规定》，建立危房改造预警体系，完善校舍维修、改造和建设保障机制。至2003年，全市累计筹措资金3.85亿元，改造危房96.4万平方米，改造学校714所，基本完成危房改造任务。
控辍保障机制
1999年11月10日、2002年11月15日市政府办公室分别下发《关于制止中小学生辍学的通知》《关于坚决制止农村初中学生辍学的通知》，将控制中小学生辍学纳入政府工作日程，作为巩固提高“两基”成果的重要工作。2004—2006年，市政府启动“两免一补”政策，实施“万名特困生救助工程”，并将此作为市政府为民办好的10件实事之一。2008年后，成立学生资助中心，建立覆盖城乡的贫困学生资助体系，每年资助各级各类学校贫困学生十几万人，贫困生辍学问题得到较好控制。2010年，全市初中辍学率控制在0.2%以内，小学生无辍学现象。加强“普九”工作动态监控，全市义务教育阶段学生学籍全部实行电子化管理。坚持以流入地政府管理为主，以公办学校为主，保障进城务工农民子女接受义务教育。
第四节 普及九年制义务教育
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“普九”工作
1990年，全市有小学4225所，在校生764231人，平均每校181人；初中479所，在校生261222人，平均每校545人。小学适龄儿童入学率98%，最低的县为91.47%；初中入学率69.4%，最低的县为53.4%。小学、初中教师学历达标率分别为77.91%、44.37%；生均公用经费初中10.24元，小学1.08元。
1991年，市政府颁布《关于实施义务教育的意见》，市委、市政府下发《关于改革和加强全市教育工作的决定》等一系列文件，各县市区按照规定的法律程序宣布实施九年制义务教育，并加强保障制度建设。1991年11月7日，市政府在兖州召开实施义务教育现场经验交流会，推动“普九”实施。1993年12月，城镇校改工作通过省政府验收，城镇校改全市四年共投资3亿元，新建校舍74.5万平方米，使城镇中小学基本达到“普九”标准。1994年10月28日，市中区的“普九”工作通过省政府评估验收，率先在济宁市基本普及九年制义务教育。11月，市委、市政府召开全市教育工作会议，市委书记王修智代表市委、市政府与12个县市区主要负责人签订实现“基本普及九年制义务教育、基本扫除青壮年文盲”即“两基”目标责任书，全市“普九”工作重点由城镇转向农村。
1995年，全市加大“普九”力度，4月10日，市政府召开义务教育工作调度会，客观分析全市“普九”形势，对加快“普九”步伐作出全面安排。市委办公室、市政府办公室下发《关于多渠道筹措教育经费有关问题的通知》，解决教育投入不足问题。11月2日，兖州市通过省政府“两基”工作评估验收，基本普及九年制义务教育。1996年4月，市政府在微山县召开全市第二次义务教育现场会，加快实施“普九”步伐。是年，曲阜市、邹城市、任城区先后通过省政府“两基”验收，基本普及九年制义务教育。1997年1月，微山县、金乡县、泗水县的“两基”工作通过省政府评估验收，完成“普九”任务。同年12月21日，汶上县通过省政府“两基”评估验收，完成“普九”任务。
1999年，市政府向梁山、嘉祥、鱼台三县拨付400万元“普九”专项资金，在春节前又安排1000万元调度款，用于解决拖欠教师工资。在东营、德州、临沂三市和全市九县市区的对口支援下，同年6月，嘉祥、梁山、鱼台三县通过省政府“两基”验收。至此，全市12个县市区全部实现“两基”，完成普及九年制义务教育任务。
巩固发展
全市“普九”工作通过省政府评估验收后，1999年8月18日，市政府办公室下发《关于进一步做好“两基”巩固提高工作的通知》，要求各县市区继续完善“普九”动态监控机制和贫困学生助学机制。“两区三市”实施“双高普九”，其他县抓“普九”的巩固和提高。2003年，市政府出台《济宁市中小学校舍安全责任追究规定》，建立危房改造预警体系，完善校舍维修、改造和建设保障机制。至2003年，全市累计筹措资金3.85亿元，改造危房96.4万平方米，改造学校714所，基本完成危房改造任务。
控辍保障机制
1999年11月10日、2002年11月15日市政府办公室分别下发《关于制止中小学生辍学的通知》《关于坚决制止农村初中学生辍学的通知》，将控制中小学生辍学纳入政府工作日程，作为巩固提高“两基”成果的重要工作。2004—2006年，市政府启动“两免一补”政策，实施“万名特困生救助工程”，并将此作为市政府为民办好的10件实事之一。2008年后，成立学生资助中心，建立覆盖城乡的贫困学生资助体系，每年资助各级各类学校贫困学生十几万人，贫困生辍学问题得到较好控制。2010年，全市初中辍学率控制在0.2%以内，小学生无辍学现象。加强“普九”工作动态监控，全市义务教育阶段学生学籍全部实行电子化管理。坚持以流入地政府管理为主，以公办学校为主，保障进城务工农民子女接受义务教育。