济宁市气象局是中央直属事业单位，接受省气象局和市委、市政府双重领导，正县级单位。实行中央和地方双重计划财务体制。1991年，市气象局设办公室、业务装备管理科（行业管理科）、人事科（纪、监、审合署）、气象台、技术中心、服务中心6个正科级机构，下设兖州、曲阜、泗水、邹城、微山、鱼台、金乡、嘉祥、汶上、梁山10个县级气象局。1999年4月，市气象局根据《山东省气象部门市（地）县基本气象系统岗位实施细则（试行）》的规定，划分为办公室、人事科（党组纪检组、监察审计室合署办公）、业务管理科、气象台、后勤服务中心、技术装备中心、气象科技服务中心、气象影视中心，庆典中心、防雷中心，人工降雨办公室。2001年12月，市气象局设办公室、业务科技科、人事科、政策法规科4个科室，辖气象台、气象科技服务中心（专业气象台）、后勤服务中心、防雷装置质量检测检验所4个事业单位。2004年4月，成立济宁市长安防雷中心。2004年6月，成立计划财务科，撤销后勤中心；增设监察审计室，与计划财务科合署办公。2006年5月，计划财务科更名为财务结算中心，监察审计室、精神文明建设办公室设在人事教育科。2008年，成立济宁市雷电防护技术中心、济宁市气象科技服务中心。2009年6月，配备专职纪检组长。
第三节 济宁市气象局
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济宁市气象局是中央直属事业单位，接受省气象局和市委、市政府双重领导，正县级单位。实行中央和地方双重计划财务体制。1991年，市气象局设办公室、业务装备管理科（行业管理科）、人事科（纪、监、审合署）、气象台、技术中心、服务中心6个正科级机构，下设兖州、曲阜、泗水、邹城、微山、鱼台、金乡、嘉祥、汶上、梁山10个县级气象局。1999年4月，市气象局根据《山东省气象部门市（地）县基本气象系统岗位实施细则（试行）》的规定，划分为办公室、人事科（党组纪检组、监察审计室合署办公）、业务管理科、气象台、后勤服务中心、技术装备中心、气象科技服务中心、气象影视中心，庆典中心、防雷中心，人工降雨办公室。2001年12月，市气象局设办公室、业务科技科、人事科、政策法规科4个科室，辖气象台、气象科技服务中心（专业气象台）、后勤服务中心、防雷装置质量检测检验所4个事业单位。2004年4月，成立济宁市长安防雷中心。2004年6月，成立计划财务科，撤销后勤中心；增设监察审计室，与计划财务科合署办公。2006年5月，计划财务科更名为财务结算中心，监察审计室、精神文明建设办公室设在人事教育科。2008年，成立济宁市雷电防护技术中心、济宁市气象科技服务中心。2009年6月，配备专职纪检组长。