1999年，国务院办公厅转发建设部等8部门《关于推进住宅产业化提高住宅质量若干意见的通知》，建设部下发《国家康居示范工程实施大纲》《商品住宅性能认定管理办法》。2000年1月，济宁市淘汰铸铁水龙头，推广应用陶瓷片密封水嘴。3月，洸河花园获建设部城市住宅小区建设试点优秀小区称号和施工质量金牌奖、建筑设计金牌奖、规划设计金牌奖、科技进步银牌奖。6月，淘汰铸铁管、镀锌管。12月，禁止使用不符合节能要求的32系列实腹钢窗，25、35系列空腹钢窗、劣质铝合金窗和外围护普通木门，禁止使用冲水量9升以上的便器和上导向直落式排水结构低水箱配件，推广使用一次冲水量6升的坐便器。
2005年，《全省建设工作要点》要求全省实行住宅性能认定的新建商品住宅比例达到30%以上。5月，冠亚星城小区通过建设部性能认定2A级预评，济宁市康居示范工程技术委员会成立。5月31日，建设部在济宁召开第五十六次国家康居示范工程评审会。“冠亚星城”成为全省新一轮首个国家康居示范工程项目。该项目创造了济宁市房地产开发的6个“第一”（第一个创建国家康居示范工程，第一个性能认定预评达到AA级，第一个建筑节能达到65%，第一个全小区铺设地板辐射采暖，第一个智能化管理二星级小区，第一个使用集中太阳能系统）。2006年1月，九巨龙房产开发公司开发的龙城水景花园通过建设部性能认定A级预评。3月，济宁市正式实施国家《住宅性能评定技术标准》。2007年7月，省建设厅在济宁召开全省建筑节能暨康居示范工程现场会，推广“冠亚星城”建设经验。2008年，济宁兴唐开发公司开发的兴唐国翠城小区和济宁恒信房地产开发有限公司开发的梁山山水家园小区申报国家可再生能源建筑应用示范推广项目，获得国家补贴资金2000余万元。同年，兖州海清丽都开发项目列入国家康居示范工程，成为长江以北第一个县级市的康居示范项目。
2009年，市建委组织申报国家可再生能源建筑应用示范城市，编写济宁市可再生能源建筑应用城市示范《实施方案》《项目汇编》《文件汇编》《金太阳示范工程》，落实可再生能源建筑应用项目136.1万平方米。推广光伏与LED照明一体化政策，建设光伏与LED照明一体化道路、广场、公园、河道各10个项目。同年，泗水海情置业公司申报国家康居示范工程并顺利通过预审。
2010年，森泰房产开发公司润景园御城组团、九巨龙房产开发公司龙城水景花园两个住宅项目通过国家2A级住宅性能认定。同年，兖州太阳花园城小区、嘉祥山水花园小区被评为2010年度山东省优秀住宅小区；森泰房产开发公司开发的润景园御城组团获得2010年度国家“广厦奖”荣誉称号。