1861年
5月 因登州口岸滩薄水浅，清廷批准将通商口岸由登州改为烟台。
8月22日 直隶候补知府王启曾主持烟台对外开放仪式，同时宣布筹建东海关。
9～10月 捻军李成、张敏行所部先后围攻莱阳、掖县、黄县、蓬莱、招远、栖霞、福山、牟平、海阳、文登等县。10月7日围攻福山城，兵至通伸岗，遭到英、法军舰炮击，转而东攻牟平。10月20日，捻军由平度、即墨分两路出胶东。
是年，基督教美国南方浸信会牧师海雅西、赫姆斯(又名花木滋)分别在登州、烟台传教。
英、法在烟台相继设领事馆。
1862年
2月14日 登莱青兵备道由莱州移驻烟台，道台崇芳兼任东海关监督。
8月 福山、黄县、蓬莱、招远、莱阳、牟平等县淫雨连绵，河水泛涨，庄稼受灾。
是年美国传教士梅里士抵登州，将所带大花生种250克交教徒杨得来试种，后逐步传开。
1863年
2月4日 潘蔚继任登莱青兵道遭台兼东海关监督。
3月23日 英国人汉南首任东海关税务司署(又称“洋关”)税务司。自此，海关大权落入英国人手中。
是年，美国在烟台设领事代办处，翌年8月改设领事馆。
1864年
是年，挪威、瑞典在烟台合设领事馆，906年分别设馆。登州发生梅理士教案，引起中美两国
交涉。
基督教美国北方长老会传教士狄考文在登州创办蒙养学堂，1876年正式定名为文会馆，增设中学课程，学制9年。
1865年
是年，英国人在烟台山建起芝罘俱乐部(亦称烟台外国总会)，为在烟外国侨民的公共娱乐场所。
1866年
县年 东海关设邮务办事处，邮递外国领事馆及海关公私信函。
基督教美国长老会传教士郭显德在烟台开办文先、会英2处男女小学。
1867年
3月 德国在烟台设领事馆。
5月1日 烟台崆峒岛灯塔建成启用，烛力约为1000支的反射定光灯。
6～8月 6月下旬东捻军赖文光率10万余人进入潍县。清钦差大臣李鸿章率清军79个营沿胶莱河一线展开阻截。28日捻军攻入掖县，29日进入莱阳。7月2日，清廷令通商大臣崇厚从天津派洋枪队500人乘船来烟台，又令登州镇标文登营、宁福营拨马步兵523人组成洋枪队，以镇压捻军。12日捻军奔袭蓬莱，14日进攻黄县城。同日攻占福山及烟台以西村庄。16日东进宁海州和海阳县、文登县。8月19日捻军在胶莱河突破清军防线西去。
9月 英国福开森公司首开英国至烟台直接贸易航线。
是年，荷兰、丹麦在烟台设代理领事馆。
1868年
是年 英国驻烟台领事阿查理勾结美、法、意等国家领事和商人潜往宁海、栖霞等地寻挖金矿，地方政府多次劝阻无效，清政府调兵弹压，始稍收敛。
登莱青兵备道在烟台设水师海防营。
蓬莱阁东北丹崖山巅灯楼建成，呈六角形，称“普照楼”。1958年加高重修。
1869年
夏、秋掖县、黄县、海阳、招远等地遭受风、旱、雹灾，农作物减产五成以上。
是年 登莱青兵备道于福山设水师营。
1870年
是年 俄国从烟台港运走华工60名，为烟台港输出的首批“契约劳工”。