登州镇本标 建于清顺治十八年(1661)，下设陆营、水师营和城守营，归登州镇标统辖。
陆营，初设左、中、右三营。清康熙七年(1668)，裁左营，保留中、右二营，驻蓬莱，中营有马兵114名，步兵465名，分管蓬莱、黄县、招远县防务；右营有马兵115名，步兵464名，分管蓬莱县、栖霞县、莱阳县、八角口、芝罘岛防务。
水师营，清顺治十八年(1661)，设水师前营于蓬莱水城。康熙四十三年(1704)，设水师后营。清同治十二年(1873)，山东巡抚丁宝桢整顿水师，组成登州水师和荣成水、师两营。登州水师营，驻蓬莱水城天桥口，有水战兵365名，守兵50名，拖缯船7只。承担东至成山头，西至武定营大沽口交界处，北至北隍城岛北45公里，计885公里海岸线的巡防。荣成水师营，驻荣成养鱼湾(又称养鱼池)。有水战兵335名，守兵50名，拖缯船7只，承担东自成山头起，南至与江苏交界处的鹰游山止，计1035公里海岸线的巡防。
城守营，时境内有文登营、宁福营、莱州营。文登营有马兵73名，步兵308名，分管文登县、荣成县、海阳县和靖海司防务；宁福营有马兵73名，步兵328名，分管宁海州、威海司、福山县和行村司防务；莱州营有马兵72名，步兵263名，分管掖县等地防务。
山东省左路巡防队 清光绪三十二年(1906)，清廷将境内驻军改为巡防营，统带聂宪藩率490人驻烟台。宣统二年(1910)，清廷命山东巡防步队36营，马队8营改编为五路。其中登州、莱州、胶州为左路，左路巡防队统领聂宪藩，辖5个营，步兵第一营548人，由统领兼管带，驻烟台；步兵第二营468人，管带王成荣，驻烟台；步兵第三营468人，管带丛馥馨，分驻文登、海阳、乳山；步兵第四营468人，管带王元煜，驻蓬莱；马兵营172人，管带范恩熔，分驻蓬莱大辛店、烟台、岗嵛、莱阳。
北洋海军 清光绪十四年(1888)，北洋海军(亦称北洋水师)成立，提督署设在威海卫刘公岛，共有大小舰船近50艘，总吨位5万余吨。全军分为中军、左翼、右翼和后军。中军为致远、靖远、经远3舰；左翼为镇远、来远、超勇3舰；右翼为定远、济远、扬威3舰；后军为镇东、镇西、镇南、镇北、镇中、镇边6舰。鱼雷艇为福龙、左一、左二、左三、右一、右二、右三7艘。提督丁汝昌，总兵刘步蟾、林泰曾(后为杨用林)，副将邓世昌、叶祖硅、林永升、邱宝仁、方伯谦。1895年中日甲午战争，北洋海军全军覆没。
青州驻防营 清光绪二十年九月(1894年10月)，清廷命青州驻防营(满族旗兵)500人进驻威海卫，归山东巡抚指挥。中日甲午威海之战后撤至烟台。光绪二十一年四月十八日(1895年5月12日)回青州。防勇和练军 清末八旗军和绿营军日渐衰败，驻守胶东清军有招募的防勇和练军，其番号常用某字称之，来去无常。1863～1899年，先后在境内驻防的有楚军、振字军、广武军、嵩武军、襄字军、东字军、福字军、巩字军、绥字军、北洋护军、河防营等45个营，2.22万人。