光绪二十二年(1896)，烟台"义昌"、"天成栈"、"顺盛"、"双盛泰"、"恒茂"、"洪
泰"、"协茂"、"福泰"八大家商号，基本左右烟台工商业的局势。光绪二十七年(1901)"八大家"商号自发组织领导机构，名日"大会"，由洪泰经理刘云第任会首，设址于烟台大庙，是为境内最早的商会组织。大庙前院山门两侧的南大厅，作为"大会"临时集会和办公的地址，商人们每日早晚"上市"，多在此洽谈生意。每日行情都印成表，分发全市各商号，作为当日行情标准，领导市场交易活动。光绪二十八年(1902)更名"烟台商务会"，设址于通惠街刘公祠内，天成栈经理王子超任会长，内设坐办(文牍)、帐房(会计)部，负责处理各项事务，经费由各商户缴纳会费供给。宣统二年(1910)改称"烟台商务总会"，由总理、协理领导，下设机构如旧。1914年，第四届烟台商务总会成立，设正副会长各1人，特别会董8人，会董40人。1916、1918年、1920年，依次分别改选成立第五、六、七届烟台商务总会。时，境内各县均成立有商会组织。1920年，烟台商务总会正式注册登记，改称烟台总商会，设文牍、调查、庶务、会计4科。时，烟台总商会下辖18个行业公会。1934年改称烟台特区商会，设主席1人，常务委员4人，执行委员10人，监察委员7人。
1938年日军入侵，商会中邹子敏、汪钧甫等人投靠日本人，此后商会基本上被日本人控制。1942年4月商会改组，邹子敏任会长。内设4科如前，另增加日文文牍、日语通译。时商会下辖74个同业公会。
解放区抗日民主政府重视商会工作。1941年，胶东区财政委员会决定分期组建县区各级商会组织。1942年10月，胶东行署颁布商会组织规程，此后各县、区先后组建商会。1945年12月，在烟台市政府领导下改选烟台商会，隋宗林任会长，牟宪民、高逵三为副会长，委员15人，内设秘书科、会计科、统调科、调解科。商会领导32个行业分会。分会组织按照所属商家多少，规定应选委员人数，多者13人，少者5人，内设正副会长及调解、调研委员。1947年10月国民党占领烟台，改为烟台市临时商会。11月，国民党政府派张敬塘等5人接管烟台商会会务，并成立由11人组成的商会整理委员会，内设秘书室、会计室、工商科、统调科、总务科。1948年11月，在烟台市人民政府主持下，成立13人组成的商会筹备委员会，设秘书科(内设文书、总务、会计三股)、调解科、调查研究科。行业公会调整为42个。1949年10月，烟台市工商业联合会筹备委员会成立，有委员27人，常务委员11人，下设接管、调解、整理行业、生产促进4个委员会，接管前商会移交的档案、财会、物品、家具等。草拟工商联简章，重新整理划分行业组织，拟定各行业公会选举办法。筹委会内设秘书、总务、统调、调解4个科，职员15人。在整顿行业组织中，将原42个行业公会划分为第一工业大组、第二工业大组、第一商业大组、第二商业大组。全市工商业按经营范围、营业性质调整扩充为66个行业组织。
1950年6月，烟台市工商界第一届会员代表大会召开，出席大会代表337名，选举产生烟台市工商业联合会第一届委员会，由36人组成，设正、副主任委员5人，常务委员8人，执行委员16人，候补委员7人。下设生产建设委员会、贸易促进委员会、统调委员会、调解委员会。工商联内设秘书科、总务科、调解科、统调科。时，牟平、莱阳、黄县、掖县等县相继建立工商联组织。此后，1953年7月，1957年5月，1958年10月，1963年1月，依次分别成立烟台市工商联第二、第三、第四、第五届委员会，其中除第四届委员会因反右斗争，为三届六次执委会联席会议改组产生外，其余均由会员代表大会选举产生。
1966年"文化大革命"开始后，市工商联被迫停止活动。1981年恢复烟台市工商联组织。1982年9月，工商联第六届会员代表大会召开，选举产生了由25人组成的第六届执委会，设正、副主任委员4人，常务委员8人，执行委员13人。内设办公室、组宣科、咨询培训科。