1945年8月烟台市人民政府成立，为县级市，隶属胶东区行政公署。1950年5月烟台市升为地级市。烟台市政府隶属山东省政府。1955年改称烟台市人民委员会，其职权及管辖范围不变。1958年5月，又由地级市改为县级市，隶属莱阳专署。
1983年8月30日，国务院决定撤销烟台地区行政公署，组建烟台市人民政府，实行市管县体制。组建后的烟台市政府辖2区、12县，代管1个县级市。同年11月1日，烟台市人民政府及下属工作部门正式挂牌办公。
1986年12月撤销黄县，成立龙口市，为省辖县级市，由烟台市代管。1987年4月撤销莱阳县，成立莱阳市，为省辖县级市，由烟台市代管。同年8月20日，经国务院和省人民政府批准，威海市升格为省辖地级市，将文登县、荣成县、乳山县、威海市域划归新组建的威海市管辖，同年10月1日析出。是年，烟台市政府辖芝罘区、福山区、掖县、招远县、蓬莱县、牟平县、海阳县、栖霞县、长岛县政府及代管龙口市、莱阳市政府。
1988年2月撤销掖县，成立莱州市，为省辖县级市，由烟台市代管。1992年1月、3月分别撤销蓬莱县、招远县，成立蓬莱市、招远市，均为省辖县级市，由烟台市代管。是年底，烟台市人民政府辖芝罘区、福山区、牟平县、海阳县、栖霞县、长岛县政府和代管龙口市、莱阳市、莱州市、蓬莱市、招远市政府。