一、矿产资源勘查
1997—1998年，省地勘局第二水文地质工程地质大队实施黄河三角洲（东营市）贝壳资源普查和垦利县特种贝壳普查，提交《黄河三角洲（东营市）贝壳资源普查工作报告》，基本查明全市贝壳资源分布，圈定贝壳矿带（床）并探获贝壳储量87.6万吨；垦利县特种贝壳普查项目提交了普查区矿床的控制程度和基本特征。1998年，山东省地矿工程勘察院开展东营市地下卤水资源普查，查清全市地下卤水埋藏分布和含卤层组特征及地下卤水化学特征；承担“东营市东城附近地热资源调查”项目，查明东城附近地热地质特征，并提出进一步开展地热资源勘查工作建议。省地勘局第二水文地质工程地质大队实施东营市利用油田报废井提卤、开发地热资源勘查项目，查明工作区深层卤水和地热地质条件及利用油田报废井提卤、开发地热资源规划。1999年，省地矿工程勘察院实施广饶县深层地下水淡水资源普查，提交《东营市广饶县深层地下水淡水资源普查报告》，查明广饶县域深层地下水水文地质条件、地下水资源及其开发利用条件，提出开发利用方案。
2001年，省地矿工程勘察院负责实施的东营市城区地热资源评价项目，基本查明东营市城区及其外围热储埋藏条件和分布规律，建立热储概念模型，并对地热流体质量与环境影响进行评价。2003年，山东省第四地质矿产勘查院对东营市广饶县大码头、河口区刘瞿阝地区煤炭资源进行调查，大致了解含煤地层分布的范围、煤层层数、煤层一般厚度、埋藏深度和矿床开采技术条件，并预测煤炭资源量3069万吨。2004年，省地矿工程集团实施东营市城区地热资源人工回灌调查项目，初步查明工作区地热地质条件和地热回灌条件，分析地热回灌的可行性，为地热资源可持续开发利用提供科学依据。
2005年，省地矿工程集团有限公司对东营市开发区地热资源开展普查，查明开发区地热地质条件，初步提交地热资源量35.4215×1017焦耳，并评价该区地热流体质量，提出合理开发利用建议。同年，省第一地质矿产勘查院实施东营市南李屋地区岩盐矿普查项目，对矿区地质、矿层地质、矿石加工技术性能、矿床开采技术条件进行研究，探求研究区岩盐矿预测的矿石资源量16.24亿吨，NaCl量13.66亿吨，并对矿床开发经济意义进行评价。2007年，省地矿工程集团有限公司对东营市南部地区进行天然矿泉水资源普查，提交《山东省东营市南部天然矿泉水资源普查报告》，查清区域水文地质条件和矿泉水特征，提出开发利用建议。同年，省第一地质矿产勘查院对全市岩盐矿资源进行调查，查明全市岩盐矿矿体地质特征，预测工作区资源量为1267.06亿吨，NaCl量为1172.79亿吨。
2008年，省第一地质矿产勘查院对广饶县西营地区开展预查工作，提交《山东省广饶县西营地区煤炭预查报告》，了解该区地质概况和煤层煤质，提出进一步勘查工作建议。同年，青岛地质工程勘察院在东营市进行油页岩矿资源调查与评价，提交《山东省东营市油页岩矿资源调查与评价报告》，在查明工作区地质概况、矿体特征和矿石特征的基础上，探求东营地区油页岩资源量1544.6亿吨。2009年，市国土资源局印发《东营市国土资源局关于加强地质勘查工作的通知》，建立地质勘查项目月报、季报制度和项目年检报告集中会审制度，要求严格落实开工报告制度和地质资料汇交管理规定，建立健全地质勘查管理动态巡查档案。同年，省第一地质勘查院、胜利油田北鑫科工贸有限责任公司实施东营市义和镇地区煤炭资源普查项目，初步查明工作区构造形态、含煤系地层厚度及分布状况，估算煤炭预测资源量4640万立方米。同年，省地矿工程集团有限公司在东营区耿井地区进行岩盐矿预查工作，提交《山东省东营市东营区耿井地区岩盐矿预查报告》，研究预查区岩盐矿成矿基本规律，提交工作区岩盐矿预测资源量4.59亿吨。
2010年，省地矿工程集团有限公司在东营市开展浅层地热能调查，提出《山东省东营市浅层地热能调查报告》，初步查明浅层地热能资源量和开发利用条件，并研究开发利用模式。省地质测绘院在河口区陈庄屋子地区开展岩盐矿普查，了解可采岩盐矿层特征及品质情况，估算远景资源量。同年，在省财政专项资金基础上，东营市财政配套960万元，组织实施东营市钾盐资源调查项目。2011年8月，市国土资源局印发《关于加强地质项目管理工作的通知》，建立项目质量保证金制度和项目诚实守信体系，规范全市地质项目实施与管理，加强全市地质矿产监督管理工作。同年，省地矿工程集团有限公司实施东营市东营凹陷钾盐资源潜力预测项目，研究东营凹陷钾盐资源成矿地质条件和资源潜力，探得钾盐矿石量0.85亿吨、伴生岩盐矿石量325.5亿吨。2011—2012年，省鲁北地质工程勘察院实施山东省利津县干热岩调查及其续作项目，了解区内干热岩赋存条件、热物理性质和开发利用条件，为干热岩资源开发利用提供依据。2012—2013年，省地矿工程集团有限公司分别开展东营市南展区地热资源普查和东营生态新城砂岩热储地热回灌试验项目，旨在查明区内地热地质条件，热储层特征及参数。通过抽水试验取得地热地质参数，估算工作区地热资源量；通过开展地热回灌试验，开展地热水梯级循环利用研究，为东营市全面推广回灌措施提供技术支撑，保护地热资源的可持续开发利用。
二、矿产开发管理
1996年，市政府办公室印发《东营市地质矿产局职能配置、内设机构和人员编制方案》，市矿产资源管理局改称市地质矿产局，副处级机构。1998年，市地矿局印发《东营市地质矿产局勘查、采矿许可证换证工作实施方案》，部署全市勘查采矿许可证换发工作。1999年6月底，市地矿局对全市矿山企业全部换发中华人民共和国采矿许可证，有效期一般为2年。8月底，东营市勘查、采矿许可证换证工作通过省地矿厅的检查验收。2000年，东营市矿业秩序治理整顿工作通过省政府检查验收，实现全市矿业秩序全面好转。2001年，市国土资源局下发通知，要求1999年发证的全市各类采矿企业办理采矿延续登记手续。8月底，全市各类采矿企业采矿延续登记完成。
2002年，省国土资源厅委托市国土资源局负责胜利油田6个油公司的矿产资源补偿费征收入库管理工作，相应增加东营市2002年度补偿费征收指标任务1000万元。12月30日，东营市第一口地热开发试验井（东热1井）顺利竣工。2003年，《东营市矿产资源总体规划》经省政府同意，省国土资源厅批复颁布实施。2004年5月26日，全省矿权市场建设与矿产资源补偿费征管工作座谈会在东营召开。2005年，国务院和山东省政府先后印发通知，全面整顿和规范矿产资源开发秩序。2006年，市政府成立东营市整顿和规范矿产资源开发秩序工作领导小组，印发《东营市矿产资源整合方案》和《东营市矿业权清理整顿实施方案》，市、县（区）、乡（镇）各级层层签订目标责任书，矿产资源整合整顿工作全面开启。
2007年，市政府发布实施《东营市地热资源管理办法》《东营市矿山地质环境保护与治理方案》。2008年，印发《东营市深化矿产资源开发整合实施方案》，全市共关闭整合矿山企业42家，超额完成省下达的全市压减74.5%的整合目标任务。11月24日，对垦利县垦利镇东麻王村区块岩盐探矿权进行公开挂牌出让，为全市首次公开出让探矿权。同年12月5日，对广饶县西刘桥乡李官村南地区矿泉水采矿权进行公开挂牌出让，为全市首次公开出让采矿权。
2011年，省政府对全市矿产资源整合工作进行验收。全市探矿权由13个整合为10个，采矿权由11个整合为10个，全面完成省政府规定的压减任务。同年，市机构编制委员会批复设立东营市矿产资源储备与勘查开发中心（副县级）。2012年，市政府发布《东营市矿产资源管理办法》。同年，修编后的《东营市地热资源管理办法》发布实施。《东营市地热资源勘查开发与保护规划（2012—2027）》，经市政府第50次专题会议研究通过后发布实施。《东营市矿业权设置方案》正式通过国土资源部备案，为全国第一个通过部备案的地市级矿业权设置方案。11月22日，东营市被国土资源部命名为“中国温泉之城”，综合评分列全国第一。2013年12月9日，市政府发布实施《山东东营中国温泉之城发展建设总体规划（2013—2020年）》。同年，市机构编制委员会批复同意市矿产资源储备与勘查开发中心加挂市地热资源管理办公室牌子。