1984年至1985年，东营市卫生防疫站未分设科室。
1986年1月，东营市卫生防疫站在东营市直科级单位不设股级内部机构的
情况下，为便于管理，内部划分为办公室、卫生科、防疫科、地方病科、计
划免疫科，任命科室负责人。办公室的主要职责是负责文秘、会务、科教、
档案、信访、督查、车辆管理和组织协调站内日常工作；卫生科的主要职责
是负责食品卫生、环境卫生、劳动卫生、学校卫生和放射卫生工作；防疫科
的主要职责是负责传染病控制与疫情管理工作；地方病科的主要职责是负责
地方病的防治工作；计划免疫科的主要职责是冷链运转生物制品的供应和区
县乡镇计划免疫技术指导工作。
1986年10月，东营市卫生防疫站食品卫生科从卫生科分出，单设科，其
职能也同时分出；财务科从东营市卫生局财务中分出。食品卫生科主要职责
是依据《中华人民共和国食品卫生法(试行)》对食品生产经营单位进行经常
性卫生监督、监测和管理；财务科的主要职责是负责固定资产管理、编写财
务会计凭证以及处理各项会计事务工作。
1987年1月17日,东营市卫生防疫站增加宣传科、检验科。宣传科的主要
职责是以健康教育为中心，配合卫生防疫工作开展宣传教育活动，普及卫生
防疫知识，增强广大人民群众的卫生意识，改变不卫生习惯；检验科主要开
展微生物检验。
1989年1月5日，东营市卫生防疫站增设查体门诊，其主要职责是对市直
监督单位食品、公共场所从业人员，工矿企业接害工人、学生进行预防性健
康查体，办公地点设在淄博路36号院内职工集资所建的350平方米的板房内，
分设五官、内科、外科、放射科。
1992年1月20日，东营市卫生防疫站增设消杀科；环境卫生科从卫生科中
分出，成为单设科室；流行病科、地方病科合并为防疫科，其职能也合并。
消杀科主要职能为卫生医疗机构消毒监测、蚊、蝇、鼠、蟑螂密度的监测及
消杀，一次性卫生用品、消杀药械的监督监测管理工作；环境卫生科的主要
职责是公共场所、化妆品的卫生监督监测和预防性卫生监督工作。
1992年4月9日，东营市卫生局建立东营市卫生局结核病控制项目办公室，
该办公室设在东营市卫生防疫站，负责全市结控项目执行管理工作；同年6
月4日，东营市编制委员会批准成立东营市结核病防治中心，挂靠在东营市
卫生防疫站，内部调剂13人，包括流行病专业人员7人、实验室人员6人，具
体协助结控项目办公室贯彻结控项目技术措施、质量控制和督导工作，与东
营市卫生局结控项目办公室合署办公。
1993年11月20日，东营市卫生防疫站成立基建办公室，其主要职责是负
责基建质量把关、建筑材料购置以及基建工作的外部关系协调。
1994年1月，东营市卫生防疫站检验科分为理化检验室、微生物检验室；
新增药械科。理化检验室的主要职责是负责卫生监督46和疾病监测理化项目
的检验工作；微生物检验室的主要职责是负责疾病监测、预防性体检和卫生
监测项目的微生物检验工作；药械科的主要职责是负责生物制品、试剂和药
械的购置供应。
1995年6月22日，东营市卫生防疫站由正科级升为正县级。
1995年7月26日， 东营市卫生防疫站内设机构为食品卫生科、环境卫生
科、学校放射卫生科、劳动卫生科、防疫科、计划免疫科、消杀科、健康教
育科、理化检验室、微生物检验室、门诊、药械科12个业务科室，办公室、
财务科、总务科3个后勤科室，其中办公室、总务科合署办公。学校放射卫
生科的主要职责是依据法律法规开展学校卫生和放射卫生的监督监测；劳动
卫生科的主要职责是依据法律法规开展劳动卫生的监督监测；总务科的主要
职责是负责后勤保障供应、水电路讯的管理、办公楼及其设施的维护工作。
1998年1月11日，东营市卫生防疫站设立预防接种门诊，隶属该站计划免
疫科，负责市区儿童计划免疫和生物制品的预防接种工作。
2002年6月1日，东营市卫生防疫站增设卫生监督科、政工科、艾滋病性
病防治中心、慢性病防治中心、预防接种门诊。世界银行贷款结核病防治办
公室更名为结核病防治中心；体检门诊更名为预防性体检科。预防接种门诊
与计划免疫科、政工科与健康教育科、性病艾滋病防治中心与慢性病防治中
心合署办公。卫生监督科的主要职责是负责该站人事以及卫生许可证、健康
证受理办理、样品受理、检验报告的编制工作；政工科的主要职责是负责该
站党群工作和精神文明建设；艾滋病性病防治中心的主要职责是负责全市艾
滋病性病工作规划、年度计划的制定以及疫情监测、疫情处理和专业人员培
训；慢性病防治中心的主要职责是负责全市慢性病工作规划、年度计划、预
防控制和基层业务指导；结核病防治中心主要职责是负责实施结控项目后期
管理工作及全国结核病防治规划（2001-2010年）在东营市的贯彻落实。
2003年5月24日，东营市卫生防疫站设立健康教育所，该所的主要职责是
负责全市健康教育工作规划和年度计划制定、市直社区医院学校厂矿等健康
教育以及全市健康教育工作的指导、督查、考核和评价工作。
2003年，东营市卫生防疫站科室设置无变化，即办公室、财务科、总务
科、流行病科、计划免疫科、食品卫生科、环境卫生科、劳动卫生科、学校
卫生科、消杀科、健康教育所、理化检验室、微生物检验室、政工科、卫生
监督科、结核病防治中心、慢性病防治中心、艾滋病性病防治中心、预防体
验科、预防接种门诊等20个科室。