前身为青岛动植物检疫所，1965年10月开始筹建，是我国国境口岸最早设立的动
植物检疫机关之一。 受农业部和山东省农业厅双重领导。1971年2月，与青岛进出口
商品检验局合署办公， 划归山东省对外贸易局领导。1976年8月，从青岛进出口商品
检验局中划出， 独立行使动植物检疫权力， 恢复农业部和山东省农业厅双重领导。
1981年9月， 由农业部动植物检疫总所直接领导。1983年7月6日，日照市石臼港对外
开放， 经国家批准设立石臼动植物检疫所，隶属青岛动植物检疫所领导。1989年5月
31日，日照市岚山港经山东省政府批准为二类开放口岸，设立岚山动植物检疫所，属
石臼动植物检疫所的分支机构。 1990年9月26日，设立青岛动植物检疫所流亭机场办
事处。之后，经农业部批准更名为中华人民共和国青岛动植物检疫局。