戚继光率军消灭了嘉靖四十一年(1562年)冬天来犯的福建倭寇，收复兴化、寿
宁等地后，便进驻福宁州。
戚家军的官兵基本上是浙江人，他们身为浙江人，却要长期守卫福建，困难很
多。将士远离家乡，再加上福建生活比浙江差，思乡之情非常迫切。只是官兵上畏
国法，又感于同戚继光的情义，才努力坚守。为顺应军心，嘉靖四十二年(1563年)
九月，戚继光将所部1万多人分成两班轮换，一班回浙江休息，一班服现役。这样，
当班的士兵便只有6400人。但戚继光仍然积极部署水陆设防，将6400人分成8营，
在福建分北、中、南三路设防，并且从北到南，在福建筑起了连绵不断的海防线，
又增修战船92艘，分给水寨，壮大了海防力量。
嘉靖四十二年(1563年)十月，倭寇发动了新的攻势。北从福宁州的烽火门，南
到泉州府的福全千户所，倭寇纷纷登陆。戚继光令各水寨、各路奋力抗击。十月内，
先后获得12次胜利，斩、俘倭寇3000余人。但倭寇的侵扰并未停止。十一月，倭寇
集中2万多兵力围攻仙游县，城中军民在知县陈大有、典史陈贤等率领下，坚守待
援。此时戚家军官兵仅6400人，沿千里防线驻防，力量比较分散，而且军中还有部
分人染上疟疾、痢疾。另外，这一班官兵守期已到，而下班官兵因为浙江当局的阻
挠，迟迟没能到达。在这种情况下，无法与倭寇决战。
戚继光一面遣使催浙兵速来，同时又和谭纶一起，在决战前进行了周密的部署。
首先加强了仙游的防御力量，预先派亲兵200入城协守。其次设疑兵计，故意鸣炮
击鼓，部队往来不停，引敌生疑，分散其攻城兵力。再次是派遣一支部队保卫省城
福州，防备突袭。最后派兵堵塞仙游通往泉州、漳州的通道，切断仙游同外面的联
系，孤立仙游。
戚继光的疑兵计使倭寇一度举棋不定。但倭寇见援兵未到，便加紧攻城。十二
月初，对仙游发动猛攻，并竖起云梯登城。守城将士奋勇杀敌，将登上城头的倭寇
砍落城下，这才暂时解除了破城之危。
直至十二月二十三日，来自浙江的下班官兵到达，明军齐集，士气重振。戚继
光仔细考虑了敌我双方力量的对比，决定集中优势兵力，攻打南门。二十六日(据
《戚少保年谱耆编》卷四。《明史·戚继光传》作嘉靖四十三年二月。)，戚家军
凭借天气的骤然变化，在漫天大雾中驰往敌营。南门的倭寇很快就被歼灭，接着又
分头冲杀，不久歼灭东门、西门以及北门之敌，危急中的仙游城终于获救。此役杀
死倭寇数千人，粉碎了倭寇对仙游的围攻，迫使残余倭寇向泉州沿海逃窜。这是继
平海卫战役以后又一次重大胜利，被称为“盖自东南用兵以来，军威未有若此之振，
军功未有若此之奇者”(《谭襄敏公奏议》卷二《请行赏罚以励人心疏》。)。仙游
之战结束后，戚继光又率部进剿残倭。次年二月，戚家军又先后在同安、漳浦等地
击败倭寇。围攻仙游的倭寇至此大部被歼，余部逃遁回国。三月、四月，又有多股
倭寇侵扰福建沿海，均遭戚家军痛击而败退。嘉靖四十四年(1565年)，戚继光率军
进入广东南澳等地，与俞大猷部配合，歼灭吴平等海盗集团，最终稳定了东南沿海
的局势。
至此，侵扰东南沿海并长期为患的倭寇，经过沿海军民十几年的艰苦奋斗，尤
其是戚继光和戚家军的英勇战斗，终于基本平息了。
为表彰戚继光在抗倭战争中的贡献，明朝廷于嘉靖四十四年(1565年)在登州城
内为其修建“母子节孝”和“父子总督”两座牌坊。