1958年10月13日，中共山东省委批准组建，下设省结核病防治所、省中医研究
所、省丝虫病防治所、省皮肤性病防治所和省黑热病防治所，共有职工280人。
1959年10月，省人民委员会批准增设沙眼防治研究所、肿瘤研究所、劳动卫生
职业病研究所、流行病学研究所、放射医学研究所、疗养事业研究所，分别附设于
省卫生防疫站、山东医学院及青岛疗养院内。1960年底，全院共有职工495人。
1961年9月,撤销沙眼防治研究所和疗养事业研究所。
1962年3月，缩编更名为省医学科学研究所，隶属省卫生厅，处级单位。1964
年11月，设流行病学、劳动卫生职业病、放射医学3个研究室。1965年5月，省卫生
厅实验药厂归属该所，称药物研究室。
1981年3月，省人民政府批准重新组建省医学科学院，厅局级事业单位，由省
卫生厅代管。院址济南市经十路35号，下属机构有劳动卫生职业病防治研究所、寄
生虫病防治研究所、肿瘤防治研究院、医学情报研究所、皮肤病防治研究所，主要
任务是防治职业病、寄生虫病、皮肤病和肿瘤等常见病多发病，提供医学科技情报，
培养硕士学位研究生。1983年12月，增设基础医学研究所、放射医学研究所及药物
研究所。
1985年6月，省编委批复同意筹建省医学科学院营养研究所。年底，全院共有
职工1232人，其中科技人员884人，含正副研究员及相当职称27人、助理研究员及
相当职称160人、研究实习员及相当职称372人。
该院拥有大型透射扫描电子显微镜、电子计算机X线断层扫描机(CT)、60
钴治疗机、美国BECKMAWLS-9800型液体闪烁计数装置、超速离心机、高压液相色
谱仪、多导生理仪、西德LEJTZ-1400型整体切片机、PDP11/23计算机及彩色录相、
摄影、印放设备等；馆藏图书47500册，中、外文期刊资料4600余种；编辑出版《
山东省医学科学院学报》、《山东工业卫生》、《山东省寄生虫病防治研究》及《
国外医学肿瘤学分册》。