1939年6月23日，集总发出第二期整军训令。中央军委总政治部指示一一五师
派干部帮助整理巩固山东纵队。8月，山东纵队整军开始，12月结束，共整理4个团；
并组建第九支队。第二期整军后的序列为：
第一支队 由第八支队改称，辖3个营。司令员马保三，政治委员周赤萍，副
司令员钱钧，参谋长杨志雅，政治部主任艾萍。
第二支队 1939年10月4日，中共山东分局决定，将津浦支队拨归山东纵队建
制。津浦支队与原第二支队合编为新的第二支队。司令员孙继先，政治委员潘寿才，
参谋长刘国柱，政治部主任孔繁彬。
第三支队 将原特务团、第十团、第七团依次缩编为第一、第二、第三营。司
令员杨国夫，政治委员徐斌洲，副司令员李人凤，参谋长鲍剑寒，政治部主任陈楚。
第五支队 除原有的第十三、第十五两个团外，10月将黄县、掖县、东海独立
营合编为第十四团。团长李希孔，政治委员张子明。
第九支队 以山东纵队特务团与第一支队第二营编成，司令员刘海涛，政治委
员刘其人。
第四支队 和陇海南进支队同前。
根据中共山东分局10月4日的决定，山东纵队将第六支队和苏鲁人民抗日义勇
队第一总队拨归八路军一一五师建制。