府为承上启下的地方行政机构，上受司、道的领导，下辖州和县。晚清时期，
山东设有济南、泰安、武定、兖州、沂州、曹州、东昌、青州、登州、莱州等10府。
济南府下辖1州15县，分别为德州及历城、章丘、邹平、淄川、长山、新城、
齐河、齐东、济阳、德平、禹城、临邑、平原、陵县、长清县。
泰安府辖1州6县，分别为东平州及泰安、东阿、平阴、新泰、莱芜、肥城县。
武定府辖1州9县，分别为滨州及惠民、阳信、海丰、乐陵、利津、沾化、蒲台、
青城、商河县。
兖州府辖有10个县，即：滋阳、曲阜、宁阳、邹县、泗水、滕县、峄县、阳谷、
寿张、汶上县。
沂州府辖1州6县，分别为莒州及兰山、郯城、费县、沂水、蒙阴、日照县。
曹州府辖1州10县，分别为濮州及菏泽、曹县、范县、观城、朝城、郓城、单
县、成武、定陶、巨野县。
东昌府辖1州9县，分别为高唐州及聊城、堂邑、博平、茌平、清平、莘县、冠
县、馆陶、恩县。
青州府辖有11个县，即益都、博山、临淄、博兴、高苑、乐安、寿光、昌乐、
临朐、安丘、诸城县。
登州府辖1州9县，分别为宁海州及蓬莱、黄县、福山、栖霞、招远、莱阳、文
登、荣成、海阳县。
莱州府辖1州3县，为平度州及掖县、潍县和昌邑县。
以上各府均设行政长官知府1人，为正印官，掌一府政令，官秩从四品。知府
下设佐贰官同知和通判。同知和通判分为两种，一种作为府的辅佐官，分理府内各
项事务。另一种不作为府的辅佐官，而专管地方某项事物，均冠以其分管专职的职
名，二者品级相同。晚清时期，山东10府设有作为知府辅佐官的同知8人(济南、武
定、兖州、曹州、东昌、青州、登州、莱州8府设)，通判4人(济南、泰安、兖州、
沂州4府设)；设有专管地方某事的同知和通判4人(兖州府设运河同知1人，并设捕
河通判1人，青州府设理事同知1人，沂州府设沂郯海赣通判1人)。府同知为正五品
官，在公文中称丞，尊称司马；通判为正六品官，尊称别驾。府还设有儒学教授，
除莱州府外其它府各设1人，莱州府设教谕1人，济南、兖州、东昌、青州、登州、
莱州6府各设复设训导(1662年(康熙元年)，大学裁训导留教谕1员，小学裁教谕留
训导1员，1680年(康熙十九年)全复通省教职，故有复设教谕、复设训导之名。)1
人，兖州府并设四氏学教授1人，学录2人，均为分掌各府生员学习儒学事务的官员。
知府的办事机构称知府衙门，其内部组织机构依各府事务繁简酌置，一般由府
堂及经历司、司狱司等组成。府堂是知府衙门内一个综合性的办事机构，直接为知
府服务，内置典吏若干人，按吏、户、礼、兵、刑、工6房办事；经历司是知府衙
门内掌管出纳文移诸事的机构，设经历1人，秩正八品；司狱司是知府衙门内掌察
理狱囚诸事的机构，设司狱1人，秩从九品。山东10府均设有府堂和经历司，济南
府设司狱司。
除知府衙门内的办事机构外，各府还设有下列所属机构：一是阴阳学，设正术
1人，品秩未入流，是府的阴阳官，兼辖星学。二是医学，设正科1人，品秩未入流，
是府属的医官。三是僧纲司，设都纲1人，品秩从九品；副都纲1人，品秩未入流，
是府内管理僧人的官员。四是道纪司，设都纪1人，秩从九品，副都纪1人，品秩未
入流，是府内管理道士的官员。以上机构各设典吏若干人，攒典1人。