1945年8月13日， 省临参会、省政委会在莒南大店镇召开联席会议，一致通过将山东省战时行政委员会改为山东省政府，省临时参议会改称省参议会。10月18日，山东省政府、山东省参议会致电美国驻华军总司令魏德迈，抗议美军干涉中国内政、支持国民党军在青岛登陆、 进攻山东解放区。1946年1月11日，山东省参议会代表全省3800万人民通电拥护1月10日由共产党、 国民党、民主同盟、青年党和社会贤达代表在重庆召开的政治协商会议，要求任何军队均驻原地不动，所有问题均由政治方式解决；反对国民党军队进攻解放区；要求承认各解放区民选自治政府，取消未经山东人民选举的以何思源为首的国民党山东政府。 1月12日，省参议会副议长马保三、知名学者钱俊瑞、新华社山东分社社长陈沂、教育厅长杨希文等，发起组织山东和平促进会，公推马保三为主任委员。3月1日，山东省参议会、山东省和平促进会通电全国，要求国民党政府制止特务破坏和平的活动。 3月25日，山东省参议会、山东省和平促进会联合举行国事座谈会，各界人士一致痛斥国民党六届二中全会推翻政协决议，并通电质问国民党是“还政于民”还是“夺政于民”。7月2日，山东省参议会、山东省政府致电美国总统及国会， 呼吁拒绝通过援蒋法案，立即撤出在鲁全部美军。7月17日，山东省参议会、山东省政府发出通电，抗议国民党指使特务于本月11日、15日暗杀昆明民主同盟负责人李公朴、 闻一多的血腥罪行，并电唁李、闻家属。7月20日，山东省参议会驻委会和山东省政府举行联席会议，决定撤销滨海行政公署，建立滨海专署，直属省政府管辖，谢辉、白涛任该专署专员；将滨北专署划归胶东行署领导。会议还推选郭子化、李澄之、薛暮桥为省政府委员。8月3日，山东省参议会发出《为反内战告全省同胞书》，号召全省同胞紧急动员起来，支援前线，粉碎国民党军队的进攻。 8月21日，山东省参议会发出给美国驻华大使司徒雷登的公开信，指出美国应停止军事援助国民党反动派，并撤退驻华美军。10月17日，山东省参议会参议员和省政府委员召开联席会议， 通过了省政府系统精简方案，将省政府的5厅、5局、3处现有的1230人减到706人。 10月20日，山东省参议会、山东省各救会和山东省文化协会召开各界人士座谈会，并致电延安，要求迅速召开解放区人民代表大会，以反对蒋介石于本月10日召开的伪国民大会。另外，10月25日，《山东省土地改革暂行条例》经山东省参议会驻会委员会和山东省政府委员会联席会议通过，由山东省政府公布施行。1949年3月30日， 山东省政府委员会及山东省参议会驻会委员会举行联席会议，决定将山东省政府改称山东省人民政府。推选康生任省人民政府主席，郭子化任第一副主席，方毅任第二副主席。