改良军事制度也是“新政”的一项重要内容，山东地方政府采取积极措施，对
旧的军队体制进行全面的改革和整顿。
山东的军事组织分为旗兵和绿营兵两大类。绿营兵在山东有抚标、河标、镇标
3种，另有军卫和运河营。这些军事单位自清初以来不断变化。 山东驻防旗兵有青
州、德州两处。光绪末年，旗民人口日多，原有旗地不足，清廷已无意使其保持原
来的军事角色。山东巡抚杨士骧于1905年奏请将利津、乐安两县毗连处的海滩淤地
600余顷拨给旗丁，以足生计；同时由青州、德州两满营挑选500名精壮士兵编入陆
军第五镇训练，驻防军至此不复存在。山东有军卫4处，屯所100余处，分隶各州县。
1897年裁临清、德州等卫，卫及所隶屯所改归所在州县。河标原有3营兵，1902 年
裁河督，河标亦被裁。运河营自1901年起即与将裁撤的河标混编，改为运河工巡营。
1903年5月，运河工巡营编成，有兵力500名，分为5哨，沿河驻扎26处， 归兖沂曹
济道管辖，至1909年被裁撤一半。抚标2营驻济南，另包括登州、兖州、 曹州等镇
所隶各营(即镇标)，原为防卫山东的主要武装力量，自清初以来不断裁减，民国建
立后即不复存在。绿营兵制自咸丰、同治年间以来即逐渐衰败，兵额不断裁减。甲
午战争后，清廷决定编练新军，并决定对各省绿营兵勇大加裁汰。山东自1896年起
即开始对绿营兵陆续进行了较大幅度的裁减。1901年8月， 清廷谕令各省将现有绿
营兵勇裁汰十分之二三，腾出饷项作为编练巡警等军之用，山东又按此比例对全省
绿营兵再度进行了裁减。1902年，山东巡抚周馥奏请将所余绿营兵5000余名全部裁
撤，改练巡警。
在绿营兵陆续被裁减的过程中，山东地方政府为增强海防和维护治安的需要，
同时不断招募新勇。这些新募兵勇和裁余的绿营兵一概参用西法训练，并配备近代
新式武器。负责全省军需的善后局，自光绪初年以后就经常购备枪械弹药，供备各
营领用。袁世凯任山东巡抚后，即着手积极编练新军，将嵩武军及东字等营编作武
卫右军先锋马步炮队20营，参仿武卫右军章程更定营制饷章；又将飞虎、佐字、济
字等营编作左右翼防军8营(归曹、兖两镇统带)，将登莱练军各营编作海防军5营，
加上抚标前军左右步队2营，共35营、17500人。后山东巡抚张人骏和周馥又将沿海
防军陆续裁改，将全省兵力减为32营、16000人。1904年， 清廷谕令各省将原有各
营严行裁汰，精选若干营，分为常备、续备、巡警各军，一律操习新式枪炮。山东
遂将武卫右军先锋队20营改为常备军，曹兖两镇防军8营及沿海防军2营、抚标前军
2营改为续备军，一律改用毛瑟枪，成为正规部队。
1905年5月，练兵处奏定在山东编练新军第五镇。 山东新军第五镇由常备军内
抽调12营组成，共12512人，其中军官748人、士兵11764人，除小部分驻扎潍县外，
大部分驻防济南。所使用的新式武器除从国外购进外，主要是由1875年山东巡抚丁
宝桢奏设的山东机器局提供，其下级军官也大部分从武备学堂毕业。新型编制、新
式装备和受过专业训练的军官，使新军第五镇成为具有近代军事技能的军队。第五
镇名义上由陆军部派遣近畿督练差管理，山东巡抚兼任督办，但实权操在时任直隶
总督兼北洋大臣的袁世凯手中。1906年，袁世凯奏请清廷以陆军部统辖各镇后，新
军第五镇即归陆军部节制，山东巡抚无权调遣。因此，从1906年起，山东地方政府
即开始增募兵勇，山东巡抚杨士骧于年底设立全省巡防营，其中游击4营、巡缉1营，
共5营兵力。巡防营是继新军第五镇之后，新编的一支纯地方性武装，受巡抚管辖。
1907年6月，陆军部通令各省将原有防营加以改编。1908年， 山东巡抚吴廷斌将巡
防5营改为中、左、右3营和左、右翼防军中营两营，驻防济南。后又增募两营为抚
标新军巡防左、右营，添马队两哨。到1910年6月，全省防营的改编工作完成， 计
编成巡防步队36营，马队8营，分5路分驻山东各地，每路设统领1员， 并各设讲武
堂1所，每营兵力定额500人。巡防营由省署直接控制，实力仅次于第五镇。防营的
设置，增强了山东地方政府的武装力量。
1901年，袁世凯任山东巡抚时即奏裁绿营制兵1360名、左右翼防军400名、 沿
海防军2营，准备改练巡警，未及实行即调任直隶总督。1902年10月， 袁世凯奏定
警务章程，清廷令各省仿照办理。山东巡抚周馥于是年11月起招募巡军，在省城济
南成立巡警局，委臬司尚其亨总理警务，负责筹饷、开办警学等事务。省城设巡警
总局后，各地亦同时开始兴办警政。至1904年8月，烟台、登州、曹州、济宁、 武
定、羊角沟等地都设立了分局，巡军亦分编为巡捕队、探访队、消防队、除秽队等
分布各处。至1906年6月，先后开办巡警的州县达98个，全省共有警兵6000 余人；
历城、章丘、长清等地都设有巡警教练所，编练地方巡警。此外，还陆续在小清河
沿岸添设了水警，省城4乡步巡之外增添了马巡，在商埠专设商埠巡警， 在矿区设
矿警，在胶济铁路沿线设铁路巡警，并设东路巡警局加以管理。
1908年巡警道设立，潘延祖任道员，将巡警总局改为巡警公所，分机要、文牍、
会计、法政、市政、卫生6科。直属巡警公所的巡警除省城的清道队、 消防队和侦
探队外，还有城内外6区、附郭4乡2区，另有小清河分区、羊角沟分区、商埠分区、
铁路分区、坊子分区以及兖沂道巡警。各区依需要设区官、司书生、巡官、巡长、
洋总巡等，统归巡警公所管理，烟台巡警由东海关道就近督导。
山东地方政府在兴办警务之初，即注重巡警教育。1902年巡警局成立后，巡抚
周馥即派弁兵100名分赴北京、天津两处警务学堂学习。1903年， 省城开办警务大
学堂，专门训练警官。1905-1906年，陆续派遣该堂官班及兵班学生赴各州县分充
巡警官、教弁等职。1906年，又在曹、兖两府分设巡警学堂。1908年，民政部奏准
各省城设高等巡警学堂，附设简易科，府厅州县设巡警教练所。山东乃将省城警务
学堂改为高等巡警学堂，于1909年3月开课。同年3月，山东巡抚袁树勋在省城设巡
警教练所1处，同时将兖、曹两府巡警学堂裁撤。